Welche Datenbank ist GTEx?
GTEx ist eine umfassende Datenbank mit Genexpressionsdaten aus menschlichen Gewebeproben. Der Inhalt umfasst RNA-Sequenzen, eQTL-Daten und andere relevante Informationen aus 53 Gewebetypen. Zu den Einsatzmöglichkeiten gehören das Verständnis der gewebespezifischen Genexpression, die Identifizierung krankheitsbedingter Gene, die Untersuchung der Genregulation und die Entwicklung personalisierter Medizin.
Was ist die GTEx-Datenbank? Die
GTEx-Datenbank (Gene Expression Histology) ist eine umfassende Ressource mit Genexpressionsdaten und zugehörigen Informationen für menschliche Gewebeproben.
Datenbankinhalt:
Die GTEx-Datenbank sammelt Proben von mehr als 700 Spendern und deckt 53 Gewebetypen ab, darunter alle wichtigen Organe und Gewebe. Die Proben wurden in über 15.000 RNA-Sequenz- (RNA-Seq) und Microarray-Datensätze organisiert.
Datentyp:
- Genexpression: Zeichnet den Expressionsgrad von Genen in jedem Gewebe auf.
- eQTL-Daten: Identifiziert spezifische genetische Varianten, die die Genexpression beeinflussen.
- Weitere relevante Daten: Einschließlich histologischer Informationen, klinischer Phänotyp und transkriptomischer Informationen.
Zweck:
Die GTEx-Datenbank bietet eine wertvolle Ressource für die biomedizinische Forschung. Es kann verwendet werden, um:
- die gewebespezifische Genexpression zu verstehen: die Expressionsmuster verschiedener Gene in verschiedenen Gewebetypen zu bestimmen.
- Identifizieren Sie krankheitsbezogene Gene: Identifizieren Sie krankheitsbezogene Gene, indem Sie die Genexpression bei erkrankten Patienten und gesunden Personen vergleichen.
- Untersuchen Sie die Genregulation: Verwenden Sie eQTL-Daten, um die genetischen Faktoren zu untersuchen, die die Genexpression beeinflussen.
- Entwickeln Sie personalisierte Medizin: Entwickeln Sie Behandlungen, die auf bestimmte Gewebe abzielen, indem Sie die gewebespezifische Genexpression analysieren.
Datenzugriff:
Daten aus der GTEx-Datenbank können kostenlos von der offiziellen Website bezogen werden. Benutzer können Datensätze nach Gewebetyp, Genen oder anderen Metadaten filtern.
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