有一个List ArrayList<Long> al=new ArrayList<Long>();里面存储了从外部获取的数据的ID并且进行了排序（随机抽取的ID，按照先后放入LIST），然后把这些ID在mongoDB通过inObj.put("_id", new BasicDBObject("$in", list));进行in查询，获取后的结果并不和LIST中ID的顺序一样，搜索了一下，有文章说不指定排序的话，mongodb会按照$natural进行排序，但是我测试了一下，并不是这样。
现在问题是怎么才能让mongodb按照list的排序获取结果呢
这是个很好的问题。其实你查的文章没有说错，不指定排序，就是按自然排序排的。只不过这个自然排序是指按照
_id的自然排序去排。你的list只是一个查询条件，就相当于x > max AND x < min指定的一个查询范围，跟排序完全没有关系，不论是什么数据库系统，都会在你指定的这个list范围内找到数据后再按自身的排序方法来排序。我的建议是你还是按这种方法去取值，取出来后，自己在java程序里循环一遍，然后跑出排序后的数组。
@joyqi 的说法不太对，MongoDB里的自然排序（也就是按$natural字段排序）与按_id字段排序是不同的。自然排序是按数据在数据文件中的组织顺序来排序的。
你可以explain一下你的查询，就能看到它利用索引的情况，比如你用下面的语句插入数据：
> db.test.insert({a:2,b:1}) > db.test.insert({a:1,b:2}) > db.test.insert({a:2,b:3}) > db.test.insert({a:1,b:4})在你不对a字段加索引时，会得到下面的结果，下面就是自然排序的结果：
> db.test.find({a:{$in:[1,2]}}) { "_id" : ObjectId("4f509380ea72116cb2137567"), "a" : 2, "b" : 1 } { "_id" : ObjectId("4f509380ea72116cb2137568"), "a" : 1, "b" : 2 } { "_id" : ObjectId("4f509380ea72116cb2137569"), "a" : 2, "b" : 3 } { "_id" : ObjectId("4f509380ea72116cb213756a"), "a" : 1, "b" : 4 }因为这时候MongoDB是排表的查询，扫到一条数据满足条件就加入到返回列表中。所以是按自然顺序来做的。
而如果你加上索引再查，会得到下面的结果
> db.test.ensureIndex({a:1}) > db.test.find({a:{$in:[1,2]}}) { "_id" : ObjectId("4f509537ea72116cb213756f"), "a" : 1, "b" : 4 } { "_id" : ObjectId("4f509530ea72116cb213756d"), "a" : 1, "b" : 2 } { "_id" : ObjectId("4f509534ea72116cb213756e"), "a" : 2, "b" : 3 } { "_id" : ObjectId("4f50952cea72116cb213756c"), "a" : 2, "b" : 1 }可以看到，结果按a为1，a为2分开了，因为按索引查询时，相当于是在索引中查多段数据，这里的例子里，相当于是查了a的范围为[1,1]和[2,2]两个范围的数据，这两次在逻辑上是串行的，先查[1,1]的数据，再查[2,2]的数据，所以这里a为1和2的分开了。
没用过mongodb，不过感觉这个问题的答案和别的关系型数据库一样的。如果你在关系型数据库中这样插入ID，而ID又是主键的话，那么数据库会自动按照ID的值进行排序，因为主键本身是一个聚集索引，要达到你想要的效果很简单，不要自己生成ID，让Mongodb生成一个自动自增的ID，这样插入时排序是按照这个自增值排序的，你读取的时候也是按照插入顺序读取的。
搜出来再排！