mapreduce 与mysql 交互 MapReduce与MySQL交互 分类:?hadoop之旅 2012-08-29 16:12 ? 377人阅读 ? 评论(0) ? 收藏 ? 举报 mapreducemysql数据库hadoopstringjdbc? 目录(?) [+] ? MapReduce技术推出后,曾遭到关系数据库研究者的挑剔和批评,认为MapReduce不
mapreduce 与mysql 交互目录(?)[+]
?MapReduce技术推出后,曾遭到关系数据库研究者的挑剔和批评,认为MapReduce不具备有类似于关系数据库中的结构化数据存储和处理能力。为此,Google和MapReduce社区进行了很多努力。一方面,他们设计了类似于关系数据中结构化数据表的技术(Google的BigTable,Hadoop的HBase)提供一些粗粒度的结构化数据存储和处理能力;另一方面,为了增强与关系数据库的集成能力,Hadoop MapReduce提供了相应的访问关系数据库库的编程接口。
MapReduce与MySQL交互的整体架构如下图所示。
?
图2-1整个环境的架构
具体到MapReduce框架读/写数据库,有2个主要的程序分别是?DBInputFormat和DBOutputFormat,DBInputFormat 对应的是SQL语句select,而DBOutputFormat 对应的是?Inster/update,使用DBInputFormat和DBOutputForma时候需要实现InputFormat这个抽象类,这个抽象类含有getSplits()和createRecordReader()抽象方法,在DBInputFormat类中由 protected String getCountQuery() 方法传入结果集的个数,getSplits()方法再确定输入的切分原则,利用SQL中的 LIMIT 和 OFFSET 进行切分获得数据集的范围 ,请参考DBInputFormat源码中public InputSplit[] getSplits(JobConf job, int chunks) throws IOException的方法,在DBInputFormat源码中createRecordReader()则可以按一定格式读取相应数据。
??????1)建立关系数据库连接
????? DBConfiguration类中提供了一个静态方法创建数据库连接:
?
public static void configureDB(Job?job,String?driverClass,String?dbUrl,String?userName,String?Password)
?
????? 其中,job为当前准备执行的作业,driverClasss为数据库厂商提供的访问其数据库的驱动程序,dbUrl为运行数据库的主机的地址,userName和password分别为数据库提供访问地用户名和相应的访问密码。
??????2)相应的从关系数据库查询和读取数据的接口
3)相应的向关系数据库直接输出结果的编程接口
数据库连接完成后,即可完成从MapReduce程序向关系数据库写入数据的操作。为了告知数据库将写入哪个表中的哪些字段,DBOutputFormat中提供了一个静态方法来指定需要写入的数据表和字段:
?
public static void setOutput(Job job,String tableName,String ... fieldName)
?
????? 其中,tableName指定即将写入的数据表,后续参数将指定哪些字段数据将写入该表。
??????虽然Hadoop允许从数据库中直接读取数据记录作为MapReduce的输入,但处理效率较低,而且大量频繁地从MapReduce程序中查询和读取关系数据库可能会大大增加数据库的访问负载,因此DBInputFormat仅适合读取小量数据记录的计算和应用,不适合数据仓库联机数据分析大量数据的读取处理。
????? 读取大量数据记录一个更好的解决办法是:用数据库中的Dump工具将大量待分析数据输出为文本数据文件,并上载到HDFS中进行处理。
?
??????1)首先创建要读入的数据
首先创建数据库"school",使用下面命令进行:
?
create database school;
?
????? 然后通过以下几句话,把我们事先准备好的sql语句(student.sql事先放到了D盘目录)导入到刚创建的"school"数据库中。用到的命令如下:
?
use school;
source d:\student.sql
?
????? "student.sql"中的内容如下所示:
?
DROP TABLE IF EXISTS `school`.`student`;
?
CREATE TABLE `school`.`student` (
`id` int(11) NOT NULL default '0',
`name` varchar(20) default NULL,
`sex` varchar(10) default NULL,
`age` int(10) default NULL,
PRIMARY KEY (`id`)
) ENGINE=InnoDB DEFAULT CHARSET=utf8;
?
INSERT INTO `student` VALUES ('201201', '张三', '男', '21');
INSERT INTO `student` VALUES ('201202', '李四', '男', '22');
INSERT INTO `student` VALUES ('201203', '王五', '女', '20');
INSERT INTO `student` VALUES ('201204', '赵六', '男', '21');
INSERT INTO `student` VALUES ('201205', '小红', '女', '19');
INSERT INTO `student` VALUES ('201206', '小明', '男', '22');
?
????? 执行结果如下所示:
?
?
????? 查询刚才创建的数据库表"student"的内容。
?
?
????? 结果发现显示是乱码,记得我当时是设置的UTF-8,怎么就出现乱码了呢?其实我们使用的操作系统的系统为中文,且它的默认编码是gbk,而MySQL的编码有两种,它们分别是:
【client】:客户端的字符集。客户端默认字符集。当客户端向服务器发送请求时,请求以该字符集进行编码。
【mysqld】:服务器字符集,默认情况下所采用的。
?
????? 找到安装MySQL目录,比如我们的安装目录为:
?
E:\HadoopWorkPlat\MySQL Server 5.5
?
????? 从中找到"my.ini"配置文件,最终发现my.ini里的2个character_set把client改成gbk,把server改成utf8就可以了。
??? 【client】端:
?
[client]
port=3306
[mysql]
default-character-set=gbk
?
??? 【mysqld】端:
?
[mysqld]
# The default character set that will be used when a new schema or table is
# created and no character set is defined
character-set-server=utf8
?
????? 按照上面修改完之后,重启MySQL服务。
?
?
????? 此时在Windows下面的数据库表已经准备完成了。
?
首先通过"FlashFXP"把我们刚才的"student.sql"上传到"/home/hadoop"目录下面,然后按照上面的语句创建"school"数据库。
?
????? 查看我们上传的"student.sql"内容:
?
??? ? 创建"school"数据库,并导入"student.sql"语句。
?
?
????? 显示数据库"school"中的表"student"信息。
?
??? ?显示表"student"中的内容。
?
?
????? 到此为止在"Windows"和"Linux"两种环境下面都创建了表"student"表,并初始化了值。下面就开始通过MapReduce读取MySQL库中表"student"的信息。
??????2)使MySQL能远程连接
????? MySQL默认是允许别的机器进行远程访问地,为了使Hadoop集群能访问MySQL数据库,所以进行下面操作。
?
mysql -u root -p
?
?
GRANT ALL PRIVILEGES ON *.* TO 'root'@'%' IDENTIFIED BY 'hadoop' WITH GRANT OPTION;
?
?
FLUSH PRIVILEGES;
?
????? 执行结果如下图。
????? Windows下面:
?
????? Linux下面:
?
???? ?到目前为止,如果连接Win7上面的MySQL数据库还不行,大家还应该记得前面在Linux下面关掉了防火墙,但是我们在Win7下对防火墙并没有做任何处理,如果不对防火墙做处理,即使执行了上面的远程授权,仍然不能连接。下面是设置Win7上面的防火墙,使远程机器能通过3306端口访问MySQL数据库。
??????解决方法:只要在'入站规则'上建立一个3306端口即可。
执行顺序:控制面板à管理工具à高级安全的Windows防火墙à入站规则
然后新建规则à选择'端口'à在'特定本地端口'上输入一个'3306'?à选择'允许连接'=>选择'域'、'专用'、'公用'=>给个名称,如:MySqlInput
?
??????3)对JDBC的Jar包处理
???? ?因为程序虽然用Eclipse编译运行但最终要提交到Hadoop集群上,所以JDBC的jar必须放到Hadoop集群中。有两种方式:
????? (1)在每个节点下的${HADOOP_HOME}/lib下添加该包,重启集群,一般是比较原始的方法。
????? 我们的Hadoop安装包在"/usr/hadoop",所以把Jar放到"/usr/hadoop/lib"下面,然后重启,记得是Hadoop集群中所有的节点都要放,因为执行分布式是程序是在每个节点本地机器上进行。
???? ?(2)在Hadoop集群的分布式文件系统中创建"/lib"文件夹,并把我们的的JDBC的jar包上传上去,然后在主程序添加如下语句,就能保证Hadoop集群中所有的节点都能使用这个jar包。因为这个jar包放在了HDFS上,而不是本地系统,这个要理解清楚。
?
DistributedCache.addFileToClassPath(new Path("/lib/mysql-connector-java-5.1.18-bin.jar"), conf);
?
?? ?? 我们用的JDBC的jar如下所示:
?
mysql-connector-java-5.1.18-bin.jar
?
???? ?通过Eclipse下面的DFS Locations进行创建"/lib"文件夹,并上传JDBC的jar包。执行结果如下:
??????备注:我们这里采用了第二种方式。
???? ?4)源程序代码如下所示
?
package?com.hebut.mr;
?
import?java.io.IOException;
import?java.io.DataInput;
import?java.io.DataOutput;
import?java.sql.Connection;
import?java.sql.DriverManager;
import?java.sql.PreparedStatement;
import?java.sql.ResultSet;
import?java.sql.SQLException;
?
import?org.apache.hadoop.filecache.DistributedCache;
import?org.apache.hadoop.fs.Path;
import?org.apache.hadoop.io.LongWritable;
import?org.apache.hadoop.io.Text;
import?org.apache.hadoop.io.Writable;
import?org.apache.hadoop.mapred.JobClient;
import?org.apache.hadoop.mapred.JobConf;
import?org.apache.hadoop.mapred.MapReduceBase;
import?org.apache.hadoop.mapred.Mapper;
import?org.apache.hadoop.mapred.OutputCollector;
import?org.apache.hadoop.mapred.FileOutputFormat;
import?org.apache.hadoop.mapred.Reporter;
import?org.apache.hadoop.mapred.lib.IdentityReducer;
import?org.apache.hadoop.mapred.lib.db.DBWritable;
import?org.apache.hadoop.mapred.lib.db.DBInputFormat;
import?org.apache.hadoop.mapred.lib.db.DBConfiguration;
?
public?class?ReadDB {
?
????public?static?class?Map?extends?MapReduceBase?implements
??????????? Mapper
{ ?
????????//?实现map函数
????????public?void?map(LongWritable key, StudentRecord value,
??????? OutputCollector
collector, Reporter reporter) ????????????????throws?IOException {
??????????? collector.collect(new?LongWritable(value.id),
????????????????????new?Text(value.toString()));
??????? }
?
??? }
?
????public?static?class?StudentRecord?implements?Writable, DBWritable {
????????public?int?id;
????????public?String?name;
????????public?String?sex;
????????public?int?age;
?
????????@Override
????????public?void?readFields(DataInput in)?throws?IOException {
????????????this.id?= in.readInt();
????????????this.name?= Text.readString(in);
????????????this.sex?= Text.readString(in);
????????????this.age?= in.readInt();
??????? }
?
????????@Override
????????public?void?write(DataOutput out)?throws?IOException {
??????????? out.writeInt(this.id);
??????????? Text.writeString(out,?this.name);
??????????? Text.writeString(out,?this.sex);
??????????? out.writeInt(this.age);
??????? }
?
????????@Override
????????public?void?readFields(ResultSet result)?throws?SQLException {
????????????this.id?= result.getInt(1);
????????????this.name?= result.getString(2);
????????????this.sex?= result.getString(3);
????????????this.age?= result.getInt(4);
??????? }
?
????????@Override
????????public?void?write(PreparedStatement stmt)?throws?SQLException {
??????????? stmt.setInt(1,?this.id);
??????????? stmt.setString(2,?this.name);
??????????? stmt.setString(3,?this.sex);
??????????? stmt.setInt(4,?this.age);
??????? }
?
????????@Override
????????public?String toString() {
????????????return?new?String("学号:"?+?this.id?+?"_姓名:"?+?this.name
??????????????????? +?"_性别:"+?this.sex?+?"_年龄:"?+?this.age);
??????? }
??? }
?
????public?static?void?main(String[] args)?throws?Exception {
?
??????? JobConf conf =?new?JobConf(ReadDB.class);
?
????????//?这句话很关键
??????? conf.set("mapred.job.tracker",?"192.168.1.2:9001");
?
??????? //?非常重要,值得关注
??????? DistributedCache.addFileToClassPath(new?Path(
?????????"/lib/mysql-connector-java-5.1.18-bin.jar"), conf);
?
????????//?设置输入类型
??????? conf.setInputFormat(DBInputFormat.class);
?
????????//?设置输出类型
??????? conf.setOutputKeyClass(LongWritable.class);
??????? conf.setOutputValueClass(Text.class);
?
????????//?设置Map和Reduce类
??????? conf.setMapperClass(Map.class);
??????? conf.setReducerClass(IdentityReducer.class);
?
????????//?设置输出目录
??????? FileOutputFormat.setOutputPath(conf,?new?Path("rdb_out"));
?
????????//?建立数据库连接
??????? DBConfiguration.configureDB(conf,?"com.mysql.jdbc.Driver",
????????????"jdbc:mysql://192.168.1.24:3306/school",?"root",?"hadoop");
?
????????//?读取"student"表中的数据
??????? String[] fields = {?"id",?"name",?"sex",?"age"?};
??????? DBInputFormat.setInput(conf, StudentRecord.class,?"student",?null,"id", fields);
?
??????? JobClient.runJob(conf);
??? }
}
?
???? ?备注:由于Hadoop1.0.0新的API对关系型数据库暂不支持,只能用旧的API进行,所以下面的"向数据库中输出数据"也是如此。
?
???? ?5)运行结果如下所示
???? ?经过上面的设置后,已经通过连接Win7和Linux上的MySQL数据库,执行结果都一样。唯独变得就是代码中"DBConfiguration.configureDB"中MySQL数据库所在机器的IP地址。
?
?
???? ?基于数据仓库的数据分析和挖掘输出结果的数据量一般不会太大,因而可能适合于直接向数据库写入。我们这里尝试与"WordCount"程序相结合,把单词统计的结果存入到关系型数据库中。
???? ?1)创建写入的数据库表
??? ? 我们还使用刚才创建的数据库"school",只是在里添加一个新的表"wordcount",还是使用下面语句执行:
?
use school;
source?sql脚本全路径
?
??? ? 下面是要创建的"wordcount"表的sql脚本。
?
DROP TABLE IF EXISTS `school`.`wordcount`;
?
CREATE TABLE `school`.`wordcount` (
`id` int(11) NOT NULL auto_increment,
`word` varchar(20) default NULL,
`number` int(11) default NULL,
PRIMARY KEY (`id`)
) ENGINE=InnoDB DEFAULT CHARSET=utf8;
?
???? ?执行效果如下所示:
?
??????2)程序源代码如下所示
?
package?com.hebut.mr;
?
import?java.io.IOException;
import?java.io.DataInput;
import?java.io.DataOutput;
import?java.sql.PreparedStatement;
import?java.sql.ResultSet;
import?java.sql.SQLException;
import?java.util.Iterator;
import?java.util.StringTokenizer;
?
import?org.apache.hadoop.filecache.DistributedCache;
import?org.apache.hadoop.fs.Path;
import?org.apache.hadoop.io.IntWritable;
import?org.apache.hadoop.io.Text;
import?org.apache.hadoop.io.Writable;
import?org.apache.hadoop.mapred.FileInputFormat;
import?org.apache.hadoop.mapred.JobClient;
import?org.apache.hadoop.mapred.JobConf;
import?org.apache.hadoop.mapred.MapReduceBase;
import?org.apache.hadoop.mapred.Mapper;
import?org.apache.hadoop.mapred.OutputCollector;
import?org.apache.hadoop.mapred.Reducer;
import?org.apache.hadoop.mapred.Reporter;
import?org.apache.hadoop.mapred.TextInputFormat;
import?org.apache.hadoop.mapred.lib.db.DBOutputFormat;
import?org.apache.hadoop.mapred.lib.db.DBWritable;
import?org.apache.hadoop.mapred.lib.db.DBConfiguration;
?
public?class?WriteDB {
????// Map处理过程
????public?static?class?Map?extends?MapReduceBase?implements
??????????? Mapper
?
????????private?final?static?IntWritable?one?=?new?IntWritable(1);
????????private?Text?word?=?new?Text();
?
????????@Override
????????public?void?map(Object key, Text value,
??????????? OutputCollector
output, Reporter reporter) ????????????????throws?IOException {
??????????? String line = value.toString();
??????????? StringTokenizer tokenizer =?new?StringTokenizer(line);
????????????while?(tokenizer.hasMoreTokens()) {
????????????????word.set(tokenizer.nextToken());
??????????????? output.collect(word,?one);
??????????? }
??????? }
??? }
?
????// Combine处理过程
????public?static?class?Combine?extends?MapReduceBase?implements
??????????? Reducer
{ ?
????????@Override
????????public?void?reduce(Text key, Iterator
values, ??????????? OutputCollector
output, Reporter reporter) ????????????????throws?IOException {
????????????int?sum = 0;
????????????while?(values.hasNext()) {
??????????????? sum += values.next().get();
??????????? }
??????????? output.collect(key,?new?IntWritable(sum));
??????? }
??? }
?
????// Reduce处理过程
????public?static?class?Reduce?extends?MapReduceBase?implements
??????????? Reducer
{ ?
????????@Override
????????public?void?reduce(Text key, Iterator
values, ??????????? OutputCollector
collector, Reporter reporter) ????????????????throws?IOException {
?
????????????int?sum = 0;
????????????while?(values.hasNext()) {
??????????????? sum += values.next().get();
??????????? }
?
??????????? WordRecord wordcount =?new?WordRecord();
??????????? wordcount.word?= key.toString();
??????????? wordcount.number?= sum;
?
??????????? collector.collect(wordcount,?new?Text());
??????? }
??? }
?
????public?static?class?WordRecord?implements?Writable, DBWritable {
????????public?String?word;
????????public?int?number;
?
????????@Override
????????public?void?readFields(DataInput in)?throws?IOException {
????????????this.word?= Text.readString(in);
????????????this.number?= in.readInt();
??????? }
?
????????@Override
????????public?void?write(DataOutput out)?throws?IOException {
??????????? Text.writeString(out,?this.word);
??????????? out.writeInt(this.number);
??????? }
?
????????@Override
????????public?void?readFields(ResultSet result)?throws?SQLException {
????????????this.word?= result.getString(1);
????????????this.number?= result.getInt(2);
??????? }
?
????????@Override
????????public?void?write(PreparedStatement stmt)?throws?SQLException {
??????????? stmt.setString(1,?this.word);
??????????? stmt.setInt(2,?this.number);
??????? }
??? }
?
????public?static?void?main(String[] args)?throws?Exception {
?
??????? JobConf conf =?new?JobConf(WriteDB.class);
?
????????//?这句话很关键
??????? conf.set("mapred.job.tracker",?"192.168.1.2:9001");
?
??????? DistributedCache.addFileToClassPath(new?Path(
????????????????"/lib/mysql-connector-java-5.1.18-bin.jar"), conf);
?
????????//?设置输入输出类型
??????? conf.setInputFormat(TextInputFormat.class);
??????? conf.setOutputFormat(DBOutputFormat.class);
????????//?不加这两句,通不过,但是网上给的例子没有这两句。
??????? conf.setOutputKeyClass(Text.class);
??????? conf.setOutputValueClass(IntWritable.class);
?
????????//?设置Map和Reduce类
??????? conf.setMapperClass(Map.class);
??????? conf.setCombinerClass(Combine.class);
??????? conf.setReducerClass(Reduce.class);
?
????????//?设置输如目录
??????? FileInputFormat.setInputPaths(conf,?new?Path("wdb_in"));
?
????????//?建立数据库连接
??????? DBConfiguration.configureDB(conf,?"com.mysql.jdbc.Driver",
????????????"jdbc:mysql://192.168.1.24:3306/school",?"root",?"hadoop");
?
????????//?写入"wordcount"表中的数据
??????? String[] fields = {?"word",?"number"?};
??????? DBOutputFormat.setOutput(conf,?"wordcount", fields);
?
??????? JobClient.runJob(conf);
??? }
}
?
???? ?3)运行结果如下所示
测试数据:
(1)file1.txt
?
hello word
hello hadoop
?
????(2)file2.txt
?
虾皮 hadoop
虾皮 word
软件 软件
?
???? ?运行结果:
?
???? ?我们发现上图中出现了"?",后来查找原来是因为我的测试数据时在Windows用记事本写的然后保存为"UTF-8",在保存时为了区分编码,自动在前面加了一个"BOM",但是不会显示任何结果。然而我们的代码把它识别为"?"进行处理。这就出现了上面的结果,如果我们在每个要处理的文件前面的第一行加一个空格,结果就成如下显示:
?
?? ?? 接着又做了一个测试,在Linux上面用下面命令创建了一个文件,并写上中文内容。结果显示并没有出现"?",而且网上说不同的记事本软件(EmEditor、UE)保存为"UTF-8"就没有这个问题。经过修改之后的Map类,就能够正常识别了。
?
????// Map处理过程
????public?static?class?Map?extends?MapReduceBase?implements
??????????? Mapper
?
????????private?final?static?IntWritable?one?=?new?IntWritable(1);
????????private?Text?word?=?new?Text();
?
????????@Override
????????public?void?map(Object key, Text value,
??????????? OutputCollector
output, Reporter reporter) ????????????????throws?IOException {
??????????? String line = value.toString();
???????????
????????????//处理记事本UTF-8的BOM问题
????????????if?(line.getBytes().length?> 0) {
????????????????if?((int) line.charAt(0) == 65279) {
??????????????????? line = line.substring(1);
??????????????? }
??????????? }
???????????
??????????? StringTokenizer tokenizer =?new?StringTokenizer(line);
????????????while?(tokenizer.hasMoreTokens()) {
????????????????word.set(tokenizer.nextToken());
??????????????? output.collect(word,?one);
??????????? }
??????? }
??? }
?
???? ?处理之后的结果:
?
?
???? ?从上图中得知,我们的问题已经解决了,因此,在编辑、更改任何文本文件时,请务必使用不会乱加BOM的编辑器。Linux下的编辑器应该都没有这个问题。Windows下,请勿使用记事本等编辑器。推荐的编辑器是: Editplus 2.12版本以上; EmEditor; UltraEdit(需要取消'添加BOM'的相关选项); Dreamweaver(需要取消'添加BOM'的相关选项) 等。
对于已经添加了BOM的文件,要取消的话,可以用以上编辑器另存一次。(Editplus需要先另存为gb,再另存为UTF-8。) DW解决办法如下: 用DW打开指定文件,按Ctrl+Jà标题/编码à编码选择"UTF-8",去掉"包括Unicode签名(BOM)"勾选à保存/另存为,即可。
??? 国外有一个牛人已经把这个问题解决了,使用"UnicodeInputStream"、"UnicodeReader"。
??? 地址:http://koti.mbnet.fi/akini/java/unicodereader/
??? 示例:Java读带有BOM的UTF-8文件乱码原因及解决方法
??? 代码:http://download.csdn.net/detail/xia520pi/4146123
?
测试数据:
????(1)file1.txt
?
MapReduce is simple
?
????(2)file2.txt
?
MapReduce is powerful is simple
?
????(3)file2.txt
?
Hello MapReduce bye MapReduce
?
??? ? 运行结果:
?
?
?? ?? 到目前为止,MapReduce与关系型数据库交互已经结束,从结果中得知,目前新版的API还不能很好的支持关系型数据库的操作,上面两个例子都是使用的旧版的API。关于更多的MySQL操作。?
??????终于完成,期间遇到的关键问题如下:
?
?
从这几天对MapReduce的了解,发现其实Hadoop对关系型数据库的处理还不是很强,主要是Hadoop和关系型数据做的事不是同一类型,各有所特长。下面几期我们将对Hadoop里的HBase和Hive进行全面了解。
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