Cet article présente principalement comment Python utilise defaultdict pour lire chaque colonne d'un fichier. Cela implique les compétences de Python en matière de lecture et d'opération de traversée des fichiers. Les amis dans le besoin peuvent s'y référer
Cet article décrit l'utilisation de. Python avec exemples. méthode defaultdict pour lire chaque colonne du fichier. Partagez-le avec tout le monde pour référence, comme suit :
#!/usr/bin/python """USAGE: python *.py align_SNP_site out_file""" import sys #import time from collections import Counter #t0=time.clock() info=open(sys.argv[1]) fast=sys.argv[2] d_c = {} d1={} d2={} for line in info: cols=line.strip().split("\t") if cols[0] == "SNP pattern": continue else: d1.setdefault(cols[4],[]).append(cols[1]) d2.setdefault(cols[7],[]).append(cols[1]) #d1.setdefault(cols[0],[]).append(cols[5]) #d2[cols[0]] = "\t".join(cols[0:3]) info.close() print len(d1) print len(d2) my_list=[] ref_fa = open("some_example.fasta", 'r') for i in ref_fa.readlines(): if i.startswith(">"): my_list.append(i.rstrip()) ref_fa.close() print len(my_list) #sys.exit() result = open(fast,'w') for k,v in d1.iteritems(): cnt1 = Counter(v) #print cnt1 result.write("%s\t" % k) for i in sorted(cnt1.items(), key = lambda x: x[1], reverse=True): result.write("%s\t%d\t"%(i[0],i[1])) result.write("\n") for k,v in d2.iteritems(): cnt2 = Counter(v) #print cnt2 result.write("%s\t" % k) for i in sorted(cnt2.items(), key = lambda x: x[1], reverse=False): result.write("%s\t%d\t"%( i[0],i[1])) result.write("\n") #t1=time.clock() #print (t1-t0)
[Recommandations associées]
1.Recommandation spéciale : Téléchargement de la version "PHP Programmer Toolbox" V0.1
2 Tutoriel vidéo gratuit Python
Ce qui précède est le contenu détaillé de. pour plus d'informations, suivez d'autres articles connexes sur le site Web de PHP en chinois!