Volcano Engine aide Shenzhen Technology à lancer le premier modèle de pré-entraînement moléculaire 3D du secteur, Uni-Mol

L'émergence continue de nouveaux médicaments a amélioré dans une certaine mesure la qualité de la vie humaine et la durée de vie moyenne. Dans le domaine de la conception de médicaments, puisqu’il existe des dizaines de millions de combinaisons de molécules médicamenteuses et de structures diverses, l’espace chimique des candidats médicaments est devenu très vaste.

Comment accélérer la conception de médicaments ? Shenzhen Technology, créée en 2018, s'engage à utiliser des algorithmes d'intelligence artificielle et de simulation moléculaire, combinés à des méthodes informatiques avancées, pour résoudre cet important problème scientifique. "Les défis des algorithmes de simulation moléculaire" . Une plateforme de conception et de simulation industrielle à micro-échelle de première génération.

Cette entreprise de haute technologie dispose de solides capacités de recherche scientifique et de mise en œuvre industrielle. Par exemple, dans le domaine de la médecine, la technologie de Shenzhen combine la théorie des perturbations de l'énergie libre, la dynamique moléculaire, des algorithmes d'échantillonnage améliorés avec le calcul haute performance via Hermite Uni-FEP, Uni-Fold, RiD et d'autres modules pour prédire avec précision la structure des protéines et les changements conformationnels. . et évaluer efficacement l'énergie libre de liaison des protéines et des ligands avec une précision chimique, fournir des conseils théoriques efficaces et précis aux développeurs de médicaments et améliorer l'efficacité de la conception et de l'optimisation des médicaments.

En raison de la dépendance linéaire des algorithmes de simulation moléculaire sur des ressources telles que la puissance de calcul, Shenzhen Technology a rencontré les défis suivants en termes de planification des ressources sous-jacentes et d'optimisation des algorithmes :

Le nombre de ressources informatiques les tâches sont volumineuses et les fluctuations sont importantes , la plate-forme sous-jacente doit fournir des capacités de planification élastiques flexibles et efficaces ;

1. Grand modèle, grande formation de mémoire ; Shenzhen Technology Choisissez de coopérer avec Volcano Engine pour obtenir des services informatiques hautes performances efficaces, fiables et flexibles.
2. Le premier modèle de pré-entraînement moléculaire 3D de l'industrie
3. Le Volcano Engine fournit à Shenzhen Technology une solution de calcul scientifique accélérée par GPU qui peut s'étendre automatiquement et de manière élastique en fonction du trafic professionnel et collecter automatiquement l'état de santé de chacun. Noeud et formuler une stratégie d'auto-guérison correspondante pour obtenir un fonctionnement et une maintenance intelligents. Par exemple, lorsqu'un nœud est indisponible, cette solution peut remplacer et reprogrammer les conteneurs sur le nœud pour garantir le bon fonctionnement de l'entreprise.

La solution de calcul scientifique s'appuie sur les produits cloud de base de Volcano Engine pour fournir un GPU de serveur de calcul accéléré élastiquement évolutif, monter des clusters de services de fichiers hautes performances et un stockage de fichiers parallèle à débit simultané ultra élevé, et correspondre au La plate-forme d'apprentissage automatique spécialement conçue pour les scénarios de calcul haute performance tels que l'IA et le calcul scientifique permet à Shenzhen Technology de se concentrer sur le développement commercial principal.

La personne concernée en charge de Shenzhen Technology a déclaré : « Après avoir utilisé des solutions informatiques scientifiques, nous pouvons nous concentrer sur la création de l'application elle-même sans acheter et gérer directement l'infrastructure telle que les serveurs sous-jacents, réduisant ainsi efficacement les coûts de maintenance informatique

. La solution de calcul scientifique Volcano Engine garantit efficacement les progrès de la recherche et du développement de Shenzhen Technology. Récemment, Shenshi Technology a publié le premier modèle de pré-entraînement moléculaire tridimensionnel Uni-Mol (https://github.com/dptech-corp/Uni-Mol).

Diagramme schématique du framework Uni-Mol

Uni-Mol utilise directement la structure moléculaire tridimensionnelle comme entrée de modèle au lieu d'utiliser des séquences unidimensionnelles ou des structures graphiques bidimensionnelles. L'apprentissage des représentations basé sur des informations tridimensionnelles permet à Uni-Mol de surpasser SOTA (état de l'art) dans presque toutes les tâches en aval liées aux molécules médicamenteuses et aux poches protéiques. Il permet également à Uni-Mol d'effectuer directement la génération de conformation moléculaire, les tâches liées à. Génération de conformation 3D telle que la prédiction de conformation de liaison protéine-ligand et dépasse les solutions existantes.

À l'avenir, Shenzhen Technology lancera également une série de fonctions de calcul d'énergie sans protéines et d'énergie libre absolue basées sur la plate-forme Volcano Engine, apportant des outils de productivité avancés innovants à l'industrie et accélérant le développement de médicaments et autres dessins.

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