ロゼッタってどんなソフトですか？

rosetta は、高分子構造をシミュレーションするための包括的なソフトウェアです。このソフトウェアは、1998 年に小さなタンパク質のアビニティオ予測のために FORTRAN で最初に作成されました。現在は、柔軟で多用途なアプリケーションとして「C」を使用して書き直されています。タンパク質と核酸の構造予測、設計、再構成のためのツール。

このチュートリアルの動作環境: Windows 10 システム、DELL G3 コンピューター。

rosettaとは

rosettaは、高分子構造をシミュレーションするための総合ソフトウェアです。これは 1998 年に初めて FORTRAN で書かれ、小さなタンパク質のアビニティオ予測に使用されました。現在は C で書き直されており、タンパク質や核酸の構造予測、設計、再構成のためのツールを含む、柔軟で多用途なアプリケーションとして機能します。ロゼッタの Web サーバーは、構造予測とタンパク質設計のために数十億回のシミュレーションを実行しました。

ロゼッタの Web サーバーはすでに構造予測とタンパク質設計のために数十億のシミュレーションを実行しており、さらに数十億、さらには数兆のシミュレーションがスーパーコンピューター クラスター上で実行されています。

研究者は、感染症、がん、自己免疫疾患の治療法をより深く理解するために、Rosetta を使用しています。さらなる応用には、ワクチン、新材料、標的タンパク質結合剤、酵素設計の開発が含まれます。

Rosetta はもともと構造予測ツールであり、CASP コミュニティ全体のブラインド予測トレーニングで一貫して優れたパフォーマンスを発揮していました。バックボーン、側鎖、配列空間を探索するためのさまざまな効率的なサンプリング アルゴリズムを提供するまでに成長し、その利点は RNA パズルや CAPRI など、よりコミュニティ全体の演習に一般化されました。ロゼッタは、エネルギースコアリング機能を広範囲にテストしており、折りたたみからドッキング、設計まで、比類のない範囲のアプリケーションを網羅しています。

Rosetta は学術機関や政府機関の研究機関が無料で利用でき、10,000 を超える無料ライセンスが使用されています。アクティブなフォーラムも含まれます。 Rosetta をダウンロードするには、ライセンスを申請してください。

Rosetta を試してみる準備ができている場合は、ここから始めてこれらのチュートリアルを試してみることをお勧めします。

関連知識の詳細については、FAQ 列をご覧ください。

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