ovito には Linux システム用のインストール パッケージはありますか?

ovito には Linux システム用のインストール パッケージがあります。 OVITO は、原子および粒子シミュレーション データの科学的視覚化および分析ソフトウェアであり、このプログラムは、オープン ソース ライセンスに基づいてすべての主要なプラットフォームで無料で利用でき、Windows、Linux、macOS などの主要なプラットフォームをサポートしています。 Linux に ovito をインストールする方法: 1. 公式 Web サイトから Linux 版の圧縮パッケージをダウンロードします; 2. tar コマンドを使用して解凍します; 3. export コマンドを使用して環境変数を設定します。

#このチュートリアルの動作環境: linux7.3 システム、Dell G3 コンピューター。

OVITO は、原子および粒子シミュレーション データの科学的な視覚化および分析ソフトウェアです。これは、科学者が物質現象と物理プロセスをより深く理解するのに役立ちます。このプログラムは、オープンソース ライセンスに基づいて、すべての主要なプラットフォーム (Windows、Linux、macOS など) で無料で利用できます。シミュレーション結果を分析、理解、説明するための強力なツールとして、ますます多くの計算シミュレーション研究で役割を果たしてきました。

ovito には Linux システム用のインストール パッケージがあります。 公式 Web サイトのダウンロード https://www.ovito.org/

##Linux での ovito のインストール

1. 公式 Web サイトから Linux 版の圧縮パッケージをダウンロードします

2. 解凍します

tar zxvf ovito-2.9.0-x86_64.tar.gz
cd ovito-2.9.0-x86_64

3. 環境変数を設定します

export OVITO_HOME=/path/to/ovito-2.9.0-x86_64
export PATH=$OVITO_HOME/bin:$PATH

解凍後、/path/to/ovito-2.9.0-x86_64 を実際のパスに変更してください。

コマンドラインに

which ovito

と入力し、ovito のパスが返されれば設定は完了したので実行してみます。

ovito

プログラムが起動に失敗し、エラー メッセージ ovito:/usr/lib64/libstdc .so.6: Version CXXABI_1.3.8 not found が表示される場合は、このバージョンの libstdc をダウンロードしてください。したがって、2 つの .so ファイルを OVITO インストールの lib/ovito/ サブディレクトリにコピーします。システム上の既存のバージョンの libstdc は OVITO バイナリと互換性がないため、これらが必要です。

次に、対応するディレクトリにコピーします

export OVITO_HOME=/path/to/ovito-2.9.0-x86_64
cp libstdc++.so.6 $OVITO_HOME/lib/ovito
cp libstdc++.so.6.0.21 $OVITO_HOME/lib/ovito

コマンドを再度実行します

ovito

インターフェイスが正常に開かれた場合は、正常に実行されたことを意味します。

Linux 環境がグラフィカル インターフェイスを十分にサポートしていない場合は、ovitos コマンドを使用してコマンド ラインで画像処理を実行できます。

エラー: nivida ライブラリが見つかりません

コンピューティング ノードで ovitos コマンドを実行すると、libnvidia-tls.so および libnvidia- glcore.so ライブラリがありません。

このライブラリは nvidia のドライバー ライブラリに含まれており、公式 Web サイトのポータル (新しいウィンドウが開きます) からダウンロードします。 Linux - x86_64 - RHEL - 6 - rpm(local) を選択し、cuda-repo-rhel6-7-5-local-7.5-18.x86_64.rpm 圧縮パッケージをダウンロードします。

次に、rpm パッケージを解凍して、これら 2 つのライブラリを見つけます。

rpm2cpio cuda-repo-rhel6-7-5-local-7.5-18.x86_64.rpm | cpio -div
cd var/cuda-repo-7-5-local
rpm2cpio xorg-x11-drv-nvidia-libs-352.39-1.el6.x86_64.rpm  | cpio -div
rpm2cpio xorg-x11-drv-nvidia-gl-352.39-1.el6.x86_64.rpm  | cpio -div
cd usr/lib64/nvidia

これらを見つけて、これら 2 つのライブラリを適切な場所にコピーし、LD_LIBRARY_PATH 環境変数に追加します。

export  LD_LIBRARY_PATH=/path/to/nvidia-lib:$LD_LIBRARY_PATH

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