Python で最小二乗法を呼び出して実装する方法

PHPz
リリース: 2023-05-19 09:09:54
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いわゆる線形最小二乗法は、方程式を解くことの連続であると理解できますが、異なるのは、未知の量が方程式の数よりはるかに小さい場合、解けな​​い問題が得られることです。最小二乗法の本質は、誤差を最小限に抑えながら未知の数値に値を割り当てることです。

最小二乗法は非常に古典的なアルゴリズムであり、私たちは高校でこの名前に触れたことがある、非常に一般的に使用されるアルゴリズムです。私は以前、線形最小二乗の原理と Python での実装について書きました: 最小二乗とその Python 実装; および scipy で非線形最小二乗を呼び出す方法: 非線形最小二乗(記事の最後にある補足コンテンツ) ;疎行列の最小二乗法である疎行列最小二乗法もあります。

以下では、numpy と scipy で実装された線形最小二乗法について説明し、2 つの速度を比較します。

numpy の実装

最小二乗法は numpy に実装されています。つまり、lstsq(a,b) は、a@x=b と同様に x を解くために使用されます。ここで、a は M× です。 N 行列; b が M 行のベクトルのとき、それは連立一次方程式を解くのとまったく同じです。 Ax=b のような連立方程式の場合、A がフルランク シミュレーションの場合は x=A−1b と表現でき、それ以外の場合は x=(AT と表現できます) A)−1ATb.

b が M×K の行列の場合、列ごとに x のセットが計算されます。

戻り値は 4 つあり、フィッティングによって得られた x、フィッティング誤差、行列 a のランク、行列 a の単一値形式です。

import numpy as np
np.random.seed(42)
M = np.random.rand(4,4)
x = np.arange(4)
y = M@x
xhat = np.linalg.lstsq(M,y)
print(xhat[0])
#[0. 1. 2. 3.]
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scipy パッケージ

scipy.linalg は最小二乗関数も提供します。関数名も lstsq で、そのパラメーター リストは

lstsq(a, b, cond=None, overwrite_a=False, overwrite_b=False, check_finite=True, lapack_driver=None)
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です。ここで、a、b は Ax です= b. どちらもオーバーライド可能なスイッチを提供します。これらを True に設定すると、実行時間を節約できます。さらに、この関数は、linalg の多くの関数が持つオプションである有限性チェックもサポートしています。戻り値は numpy の最小二乗関数と同じです。

cond は、特異値のしきい値を示す浮動小数点パラメータです。特異値が cond 未満の場合、特異値は破棄されます。

lapack_driver は文字列オプションで、LAPACK のどのアルゴリズム エンジンが選択されているかを示します。オプションで「gelsd」、「gelsy」、「gelss」です。

import scipy.linalg as sl
xhat1 = sl.lstsq(M, y)
print(xhat1[0])
# [0. 1. 2. 3.]
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速度比較

最後に、2 つの最小二乗関数セットの速度比較を行います

from timeit import timeit
N = 100
A = np.random.rand(N,N)
b = np.arange(N)

timeit(lambda:np.linalg.lstsq(A, b), number=10)
# 0.015487500000745058
timeit(lambda:sl.lstsq(A, b), number=10)
# 0.011151800004881807
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今回は、2 つの関数はそれほど離れていません。つまり、行列の次元が 500 に拡大されても、この 2 つはほぼ同じになります。

N = 500
A = np.random.rand(N,N)
b = np.arange(N)

timeit(lambda:np.linalg.lstsq(A, b), number=10)
0.389679799991427
timeit(lambda:sl.lstsq(A, b), number=10)
0.35642060000100173
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補足

Python は非線形最小二乗法を呼び出します

導入とコンストラクター

In In scipy さん、非線形最小二乗法の目的は、誤差関数の二乗和を最小化する一連の関数を見つけることです。これは次の式で表されます

Python で最小二乗法を呼び出して実装する方法

ここで、ρ は損失関数を表し、f

i(x) の前処理として理解できます。

scipy.optimize は、

least_squares(fun, x0, jac, bounds, method, ftol, xtol, gtol, x_scale, f_scale, loss, jac_sparsity, max_nfev, verbose, args, kwargs)
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として定義される非線形最小二乗関数 minimum_squares をカプセル化します。このうち、func と x0 は必須パラメータであり、func は解く関数、x0 はfunction input の初期値。これら 2 つのパラメータにはデフォルト値はありません。これらは入力する必要があるパラメータです。

bound は解決間隔です。デフォルトは (−∞,∞) です。verbose が 1 の場合、終了出力が表示されます。verbose が 2 の場合、操作中の詳細情報が出力されます。 。さらに、次のパラメータを使用してエラーを制御しますが、これは比較的簡単です。

ftol-8#10-8独立変数許容差#10#勾配許容差 #xx_scale変数の特性スケールf_scale1.0残余マージン価値############

loss为损失函数,就是上面公式中的ρ \rhoρ,默认为linear,可选值包括

Python で最小二乗法を呼び出して実装する方法

迭代策略

上面的公式仅给出了算法的目的,但并未暴露其细节。关于如何找到最小值,则需要确定搜索最小值的方法,method为最小值搜索的方案,共有三种选项,默认为trf

  • trf:即Trust Region Reflective,信赖域反射算法

  • dogbox:信赖域狗腿算法

  • lm:Levenberg-Marquardt算法

这三种方法都是信赖域方法的延申,信赖域的优化思想其实就是从单点的迭代变成了区间的迭代,由于本文的目的是介绍scipy中所封装好的非线性最小二乘函数,故而仅对其原理做简略的介绍。

Python で最小二乗法を呼び出して実装する方法

其中r为置信半径,假设在这个邻域内,目标函数可以近似为线性或二次函数,则可通过二次模型得到区间中的极小值点sk。然后以这个极小值点为中心,继续优化信赖域所对应的区间。

Python で最小二乗法を呼び出して実装する方法

雅可比矩阵

在了解了信赖域方法之后,就会明白雅可比矩阵在数值求解时的重要作用,而如何计算雅可比矩阵,则是接下来需要考虑的问题。jac参数为计算雅可比矩阵的方法,主要提供了三种方案,分别是基于两点的2-point;基于三点的3-point;以及基于复数步长的cs。一般来说,三点的精度高于两点,但速度也慢一倍。

此外,可以输入自定义函数来计算雅可比矩阵。

测试

最后,测试一下非线性最小二乘法

import numpy as np
from scipy.optimize import least_squares

def test(xs):
    _sum = 0.0
    for i in range(len(xs)):
        _sum = _sum + (1-np.cos((xs[i]*i)/5)*(i+1))
    return _sum

x0 = np.random.rand(5)
ret = least_squares(test, x0)
msg = f"最小值" + ", ".join([f"{x:.4f}" for x in ret.x])
msg += f"\nf(x)={ret.fun[0]:.4f}"
print(msg)
'''
最小值0.9557, 0.5371, 1.5714, 1.6931, 5.2294
f(x)=0.0000
'''
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ソース:yisu.com
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デフォルト値
備考
10#機能許容範囲#xtol
#gtol-8
1.0