pdbファイルの開き方

百草
リリース: 2023-11-21 09:40:18
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pdb ファイルを開くソフトウェアは次のとおりです: 1. Microsoft Excel; 2. BIOVIA Materials Studio; 3. RCSB PDB; 4. PyMOL; 5. UCSF Chimera; 6. Gromacs; 7. NACCESS など。詳細な紹介: 1. Microsoft Excel、PDB ファイルはテキスト形式で保存されるため、Excel などで PDB ファイルを開いた後、Excel を使用して開くことができます。

pdbファイルの開き方

PDB ファイルは、次のようなさまざまなソフトウェアで開くことができます:

1. Microsoft Excel: PDB ファイルテキスト形式で保存されているため、Excel を使用して開くことができます。 Excel で PDB ファイルを開くと、タンパク質名、原子座標などを含む各エントリのデータを確認できます。

2. BIOVIA Materials Studio: これは、PDB ファイル形式を開くことができるプロフェッショナルな分子モデリング ソフトウェアです。 Material Studio で PDB ファイルを開いた後、分子の 3D 構造を表示および編集できます。

3. RCSB PDB: これは PDB ファイルの処理に特化した公式 Web サイトであり、オンライン PDB ファイルの参照およびクエリ機能を提供します。ユーザーは、PDB ファイルを Web サイト上で直接開いて表示できます。

4. PyMOL: PDB ファイル形式を開くことをサポートする分子可視化ソフトウェアです。 PyMOL は分子の 3D 構造を表示でき、豊富な視覚化ツールと機能を提供します。

5. UCSF Chimera: これは、PDB ファイル形式を開くこともサポートするもう 1 つの分子視覚化ソフトウェアです。 Chimera には、強力なグラフィカル インターフェイスと、分子構造の表示と分析に使用できるさまざまな視覚化ツールが備わっています。

6. Gromacs: PDB ファイル形式を開くことができる分子動力学シミュレーション用ソフトウェアです。 Gromacs を使用すると、分子の動的挙動と相互作用を研究できます。

7. NACCESS: これは、分子表面と溶媒へのアクセス性を計算するために特別に使用されるソフトウェアであり、PDB ファイル形式を開くこともサポートしています。 NACCESS は、溶媒への曝露と分子の相互作用を分析するために使用できます。

上記のソフトウェアはすべて PDB ファイルを開くことができますが、どれを選択するかは、ニーズと使用シナリオによって異なります。 PDB ファイル内のデータを表示するだけの場合は、Microsoft Excel またはオンラインの RCSB PDB Web サイトを使用するだけで十分です。分子モデリング、分子可視化、分子動力学シミュレーションを実行する必要がある場合は、BIOVIA Materials Studio、PyMOL、UCSF Chimera、Gromacs などの専用ソフトウェアを使用する必要があります。

以上がpdbファイルの開き方の詳細内容です。詳細については、PHP 中国語 Web サイトの他の関連記事を参照してください。

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ソース:php.cn
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