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CentOSのインストールMUMmerとインストール方法

WBOY
リリース: 2024-02-15 08:03:06
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php エディタ Xiaoxin は、MUMmer を CentOS にインストールするための詳細なチュートリアルを提供します。 MUMmer はゲノム配列を比較するためのツールであり、バイオインフォマティクスの分野で広く使用されています。この記事では、必要な依存環境や具体的なインストール手順など、MUMmer のインストール方法を紹介します。この記事で説明されている手順に従うことで、CentOS システムに MUMmer を正常にインストールでき、その後のゲノム比較作業の準備が整います。一緒に学びましょう!

CentOSのインストールMUMmerとインストール方法

ソフトウェアをインストールする前に、まずシステムを更新して、インストール中に使用されるソフトウェア パッケージが最新バージョンであることを確認する必要があります。ターミナルを開いて次のコマンドを実行します。 root ユーザー:

```

yum update

このコマンドは、システム内のすべてのソフトウェア パッケージを確認して更新します。

MMUMmer は他のいくつかのソフトウェア パッケージに依存しているため、最初にこれらの依存パッケージをインストールする必要があります。次のコマンドを実行して必要なソフトウェア パッケージをインストールします:

yum install gcc make zlib-devel

これらのパッケージは、MUMmer をコンパイルして実行するために必要な機能を提供します。

MUMmer をインストールする前に、公式 Web サイトから MUMmer のソース コードをダウンロードし、Web ブラウザを開き、MUMmer の公式 Web サイト () にアクセスして、最新バージョンのソース コードをダウンロードする必要があります。

##ダウンロードが完了したら、ソース コードを選択したディレクトリに解凍します。ターミナルで、解凍されたソース コード ディレクトリに切り替え、次のコマンドを実行して MUMmer をコンパイルしてインストールします。

make check

make install

これらのコマンドは MUMmer をコンパイルし、システムにインストールします。

インストールが完了したら、次のコマンドを実行して MUMmer が正常にインストールされたかどうかを確認できます。

nucmer --version

インストールが成功した場合、 MUMmerのバージョン情報が表示されます。

この記事では、MUMmer を CentOS にインストールする方法を紹介します。システムを更新し、必要な依存関係をインストールし、ソース コードをダウンロードし、MUMmer をコンパイルしてインストールすることで、MUMmer を CentOS に正常にインストールして使用して、ゲノム比較や配列解析を行うことができます。

Linux オペレーティング システムでは、`chmod` コマンドを使用してファイルまたはディレクトリのアクセス許可を変更できます。異なるアクセス許可を設定することで、ファイルまたはディレクトリへのアクセス許可を制御できます。アクセス許可は分割されています。所有者、グループ、その他のユーザーに対して、「chmod」コマンドはさまざまなパラメーターを使用してさまざまな権限を設定します。たとえば、「chmod x file」はファイルを実行可能権限として設定することを意味します。

以上がCentOSのインストールMUMmerとインストール方法の詳細内容です。詳細については、PHP 中国語 Web サイトの他の関連記事を参照してください。

ソース:xiaosiseo.com
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