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これらのフォルダーはブランチではなくワークツリーです
一般に、フォルダーは同時に存在する必要がありますが、ブランチは同時に存在する必要はありません
まあ、git の基礎知識を簡単に理解しておいた方が良いと思います。数時間あれば十分です。 Git チュートリアル
上記に同意し、基本的な知識を学び、少なくとも作業ディレクトリとブランチを区別してください。おすすめ情報です。
http://book.haoduoshipin.com/gitbeijing/
http://www.bootcss.com/p/git-guide/
マーク良い勉強