pembangunan bahagian belakang
Golang
Laksanakan aplikasi bioinformatik yang cekap menggunakan bahasa Go
Laksanakan aplikasi bioinformatik yang cekap menggunakan bahasa Go
Dalam bidang bioinformatik yang sentiasa berkembang, membangunkan aplikasi yang cekap adalah penting. Go ialah pilihan yang patut dipertimbangkan sebagai bahasa yang pantas, serentak, selamat memori dengan keupayaan untuk mengurus data dan rangkaian berskala besar. Dalam artikel ini, kami akan membincangkan cara melaksanakan aplikasi bioinformatik yang cekap menggunakan bahasa Go.
Bahasa Go ialah bahasa pengaturcaraan sumber terbuka yang dibangunkan oleh Google Ia mudah dipelajari dan cekap dalam pelaksanaan. Model konkurensi bahasa Go menggunakan goroutin dan saluran untuk mengurus dan mengawal interaksi antara pelbagai tugas dengan mudah, yang menjadikan bahasa Go sangat berkesan apabila memproses data bioinformatik. Selain itu, bahasa Go juga mempunyai beberapa ciri yang tidak dimiliki oleh bahasa lain, seperti kitar semula memori automatik, rangka kerja ujian terbina dalam dan perpustakaan standard yang berkuasa.
Berikut ialah beberapa contoh aplikasi bioinformatik yang dilaksanakan dalam Go:
- BLAST: BLAST (Alat Carian Penjajaran Tempatan Asas) ialah kaedah yang digunakan untuk membandingkan Alat jujukan biologi yang menanyakan pangkalan data untuk urutan yang serupa dengan urutan yang diberikan. Mudah untuk menulis alat BLAST yang cekap menggunakan bahasa Go. G Blast ialah perpustakaan BLAST yang ditulis dalam Go yang memberikan keseimbangan yang baik antara kelajuan dan ketepatan.
- Seqkit: Seqkit ialah alat baris arahan untuk operasi jujukan biologi, yang boleh digunakan untuk memproses FASTA, FASTQ, GFF, BED dan format data lain. Seqkit ditulis dalam bahasa Go dan mempunyai keupayaan untuk mengendalikan set data berskala besar.
- Goseq: Goseq ialah alat untuk membandingkan jujukan RNA, yang boleh mengira ungkapan transkrip dan melakukan analisis ekspresi pembezaan. Oleh kerana Goseq ditulis dalam bahasa Go, ia mempunyai keupayaan untuk mengendalikan set data berskala besar dengan cekap.
Selain contoh di atas, terdapat banyak aplikasi bioinformatik yang dilaksanakan dalam bahasa Go, seperti fastp, HTSeq, GlimmerHMM, dll.
Faedah menggunakan bahasa Go untuk melaksanakan aplikasi bioinformatik ialah ia boleh mengendalikan set data berskala besar dengan mudah dan mencapai keselarasan yang cekap. Selain itu, bahasa Go boleh dibina dengan mudah ke dalam binari statik pada masa penyusunan, yang menjadikan penggunaan dan penggunaan aplikasi lebih mudah dan fleksibel.
Secara keseluruhannya, menggunakan bahasa Go untuk melaksanakan aplikasi bioinformatik ialah pilihan yang sangat baik. Ia boleh mengendalikan set data berskala besar dengan cekap dan mempunyai model konkurensi yang berkuasa dan perpustakaan standard yang kaya. Oleh itu, jika anda sedang membangunkan aplikasi bioinformatik, menganggap bahasa Go adalah pilihan yang baik.
Atas ialah kandungan terperinci Laksanakan aplikasi bioinformatik yang cekap menggunakan bahasa Go. Untuk maklumat lanjut, sila ikut artikel berkaitan lain di laman web China PHP!
Alat AI Hot
Undresser.AI Undress
Apl berkuasa AI untuk mencipta foto bogel yang realistik
AI Clothes Remover
Alat AI dalam talian untuk mengeluarkan pakaian daripada foto.
Undress AI Tool
Gambar buka pakaian secara percuma
Clothoff.io
Penyingkiran pakaian AI
AI Hentai Generator
Menjana ai hentai secara percuma.
Artikel Panas
Alat panas
Notepad++7.3.1
Editor kod yang mudah digunakan dan percuma
SublimeText3 versi Cina
Versi Cina, sangat mudah digunakan
Hantar Studio 13.0.1
Persekitaran pembangunan bersepadu PHP yang berkuasa
Dreamweaver CS6
Alat pembangunan web visual
SublimeText3 versi Mac
Perisian penyuntingan kod peringkat Tuhan (SublimeText3)
Topik panas
Cara menggunakan refleksi untuk mengakses medan dan kaedah persendirian dalam golang
May 03, 2024 pm 12:15 PM
Anda boleh menggunakan refleksi untuk mengakses medan dan kaedah peribadi dalam bahasa Go: Untuk mengakses medan peribadi: dapatkan nilai pantulan nilai melalui reflect.ValueOf(), kemudian gunakan FieldByName() untuk mendapatkan nilai pantulan medan dan panggil Kaedah String() untuk mencetak nilai medan . Panggil kaedah persendirian: dapatkan juga nilai pantulan nilai melalui reflect.ValueOf(), kemudian gunakan MethodByName() untuk mendapatkan nilai pantulan kaedah, dan akhirnya panggil kaedah Call() untuk melaksanakan kaedah. Kes praktikal: Ubah suai nilai medan persendirian dan panggil kaedah persendirian melalui refleksi untuk mencapai kawalan objek dan liputan ujian unit.
Petua untuk mencipta fungsi baharu secara dinamik dalam fungsi golang
Apr 25, 2024 pm 02:39 PM
Bahasa Go menyediakan dua teknologi penciptaan fungsi dinamik: penutupan dan refleksi. penutupan membenarkan akses kepada pembolehubah dalam skop penutupan, dan refleksi boleh mencipta fungsi baharu menggunakan fungsi FuncOf. Teknologi ini berguna dalam menyesuaikan penghala HTTP, melaksanakan sistem yang sangat boleh disesuaikan dan membina komponen boleh pasang.
Perbezaan antara ujian prestasi dan ujian unit dalam bahasa Go
May 08, 2024 pm 03:09 PM
Ujian prestasi menilai prestasi aplikasi di bawah beban yang berbeza, manakala ujian unit mengesahkan ketepatan satu unit kod. Ujian prestasi memfokuskan pada mengukur masa tindak balas dan daya pemprosesan, manakala ujian unit memfokuskan pada output fungsi dan liputan kod. Ujian prestasi mensimulasikan persekitaran dunia sebenar dengan beban tinggi dan serentak, manakala ujian unit dijalankan di bawah beban rendah dan keadaan bersiri. Matlamat ujian prestasi adalah untuk mengenal pasti kesesakan prestasi dan mengoptimumkan aplikasi, manakala matlamat ujian unit adalah untuk memastikan ketepatan dan keteguhan kod.
Apakah perangkap yang perlu kita perhatikan semasa mereka bentuk sistem teragih dengan teknologi Golang?
May 07, 2024 pm 12:39 PM
Perangkap dalam Bahasa Go Semasa Merekabentuk Sistem Teragih Go ialah bahasa popular yang digunakan untuk membangunkan sistem teragih. Walau bagaimanapun, terdapat beberapa perangkap yang perlu diberi perhatian apabila menggunakan Go yang boleh menjejaskan kekukuhan, prestasi dan ketepatan sistem anda. Artikel ini akan meneroka beberapa perangkap biasa dan memberikan contoh praktikal tentang cara mengelakkannya. 1. Terlalu banyak menggunakan concurrency Go ialah bahasa concurrency yang menggalakkan pembangun menggunakan goroutine untuk meningkatkan paralelisme. Walau bagaimanapun, penggunaan konkurensi yang berlebihan boleh menyebabkan ketidakstabilan sistem kerana terlalu banyak gorout bersaing untuk mendapatkan sumber dan menyebabkan overhed penukaran konteks. Kes praktikal: Penggunaan concurrency yang berlebihan membawa kepada kelewatan respons perkhidmatan dan persaingan sumber, yang ditunjukkan sebagai penggunaan CPU yang tinggi dan overhed kutipan sampah yang tinggi.
Perpustakaan dan alatan teknologi Golang yang digunakan dalam pembelajaran mesin
May 08, 2024 pm 09:42 PM
Perpustakaan dan alatan untuk pembelajaran mesin dalam bahasa Go termasuk: TensorFlow: perpustakaan pembelajaran mesin popular yang menyediakan alatan untuk membina, melatih dan menggunakan model. GoLearn: Satu siri algoritma pengelasan, regresi dan pengelompokan Gonum: Pustaka pengkomputeran saintifik yang menyediakan operasi matriks dan fungsi algebra linear.
Bolehkah parameter pembolehubah golang digunakan untuk mengembalikan nilai fungsi?
Apr 29, 2024 am 11:33 AM
Dalam bahasa Go, parameter pembolehubah tidak boleh digunakan sebagai nilai pulangan fungsi kerana nilai pulangan fungsi mestilah daripada jenis tetap. Variadik adalah jenis yang tidak ditentukan dan oleh itu tidak boleh digunakan sebagai nilai pulangan.
Peranan teknologi Golang dalam pembangunan IoT mudah alih
May 09, 2024 pm 03:51 PM
Dengan keselarasan tinggi, kecekapan dan sifat merentas platform, bahasa Go telah menjadi pilihan ideal untuk pembangunan aplikasi Internet Perkara (IoT) mudah alih. Model keselarasan Go mencapai tahap keselarasan yang tinggi melalui goroutine (coroutine ringan), yang sesuai untuk mengendalikan sejumlah besar peranti IoT yang disambungkan pada masa yang sama. Penggunaan sumber Go yang rendah membantu menjalankan aplikasi dengan cekap pada peranti mudah alih dengan pengkomputeran dan storan terhad. Selain itu, sokongan merentas platform Go membolehkan aplikasi IoT digunakan dengan mudah pada pelbagai peranti mudah alih. Kes praktikal menunjukkan penggunaan Go untuk membina aplikasi penderia suhu BLE, berkomunikasi dengan penderia melalui BLE dan memproses data masuk untuk membaca dan memaparkan bacaan suhu.
Evolusi konvensyen penamaan fungsi golang
May 01, 2024 pm 03:24 PM
Evolusi konvensyen penamaan fungsi Golang adalah seperti berikut: Peringkat awal (Go1.0): Tiada konvensyen formal dan penamaan unta digunakan. Konvensyen garis bawah (Go1.5): Fungsi yang dieksport bermula dengan huruf besar dan diawali dengan garis bawah. Konvensyen fungsi kilang (Go1.13): Fungsi yang mencipta objek baharu diwakili oleh awalan "Baharu".
