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2. 依照自身需求使用裡面的一些類別" >2. 依照自身需求使用裡面的一些類別
3. 寫RScript腳本" >3. 寫RScript腳本
4. 編寫我們的PHP函數" >4. 編寫我們的PHP函數
5. 成功實現" >5. 成功實現
四、失敗的原因" >四、失敗的原因
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PHP中如何呼叫RScript腳本(附程式碼)

Jul 29, 2016 am 08:33 AM
php

這篇文章主要介紹了PHP中如何呼叫RScript腳本,有一定的參考價值,有興趣的朋友可以參考一下,希望對你有幫助!

由於某個原因,需要在PHP中呼叫R語音進行繪製影像。經過多方百度,目前大部分解決方案都是:利用PHP中的系統命令函數如exec,system,shell_exec等等來呼叫RScript腳本,常見的命令列有以下兩種

第一種:

exec("RScript " . $your_script_dir . "$your_RScript_file " . $args);    // 里面有printf某个变量
// echo ("RScript " . $your_script_dir . "$your_RScript_file " . $args);
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第二種:

 system("R --slave < " . $your_RScript_dir . "$your_RScript_file" . " --args " . $args); // 里面有printf某个变量
// echo ("R --slave < " . $your_RScript_dir . "$your_RScript_file" . " --args " . $args);
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接下來,我們滿懷信心地去運行PHP的時候,會發現我們所執行系統命令返回的值是1,也就是失敗。但是,我們拿echo出來的語句到cmd視窗執行,發現是可以printf出結果,也產生了我想要的圖像。這是為什麼呢?經過多方百度跟嘗試,終於找到解決方案。供大家參考並歡迎大家如果有更好的方法,也在留言區發文,大家共同努力進步。

 一、簡單看下失敗的調用情況

PHP中如何呼叫RScript腳本(附程式碼)這是我在PHP中調用的R腳本的語句,下面是在瀏覽器中呼叫的結果。

PHP中如何呼叫RScript腳本(附程式碼)

我們再將echo出來的語句,在cmd中執行下。結果如下:

PHP中如何呼叫RScript腳本(附程式碼)產生的檔案如下:

PHP中如何呼叫RScript腳本(附程式碼)

可以看到,最後想要得到的$plotName是null,也就是沒有執行成功,或沒有得到cmd中列印出來的文件資訊。

二、解決方法

提供一個PHP插件,名字叫RServe,這個你如果是用Java來呼叫R語言的,想必並不陌生。現在出了PHP版的,我們就可以拿過來使用。下載地址:Rserve-php

三、如何使用

當然,插件有中間也有一些簡單的例子,可以自行參考理解。下面放出我的解決方法:本人是基於ThinkPHP5的框架實現的。

1. 我們首先要將它加入到我們的專案中,我把該插件放到我的vendor裡。新增以下程式碼:

require_once ROOT_PATH . &#39;vendor/rserve/autoload.php&#39;;
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2. 依照自身需求使用裡面的一些類別

use Sentiweb\Rserve\Connection;            // 连接R服务的类
use Sentiweb\Rserve\Evaluator;             // 简单的理解为:建立连接后返回的处理器
use Sentiweb\Rserve\REXP\Vector;           // 内置的存储容器
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3. 寫RScript腳本

我們需要將先前所寫的腳本,修改為R語言的函數。格式如下:

RScript <- function(arg1, ..., argN) {
    # code... 请无视这种注释方式,R语言没有注释
    return output    # 该函数的返回值
}
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為後期我們利用Rserve插件來呼叫。

4. 編寫我們的PHP函數

我們為了後期方便調用,將調用RScript腳本的功能統一寫到一個函數裡面,方便閱讀且容易維護。

class Common {
    // $source 表示自己编写的R语言函数文件
    // $file, $cancer:本R函数所需要参数
    function RScript($source, $file, $cancer) {
        $cnx = new Connection(RSERVE_HOST);                    // 与RSERVE_HOST建立连接,一般为自己服务器地址,如果本地,则为localhost
        $eval = new Evaluator($cnx, Evaluator::PARSER_REXP);   // 通过连接,生成处理器,后一个参数决定连接失败时返回错误信息
        $eval->evaluate("source(&#39;$source&#39;)");                  // 类似library,将函数载入R的编程环境中;evaluate计算括号内的R命令
        // 同理,执行R命令,注意括号内是字符串的形式,由于返回的是RServe的Rstring类,为了拿到我想要的信息,通过Vector类的toHTML转为含return信息的标签语言
        $RString = $eval->evaluate("RScript(&#39;$file&#39;, &#39;$cancer&#39;)")->toHTML();    
        preg_match("/$cancer.+.pdf/", $RString, $fileName);    // 提炼信息
        return $fileName[0];                                   // 返回结果
    }
}
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5. 成功實現

這裡我就不展示我的最終結果了,有這需要的同學們可以自己嘗試。

四、失敗的原因

由於專案時間緊迫,對PHP、R語言熟悉度不高,不明白為什麼直接呼叫指令執行的結果是失敗的。有這方面認識的朋友們,可以在評論裡回覆我。以上就是我關於PHP如何呼叫R語言腳本的全部解決方案。謝謝大家的閱讀。

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