PHP中如何呼叫RScript腳本(附程式碼)
這篇文章主要介紹了PHP中如何呼叫RScript腳本,有一定的參考價值,有興趣的朋友可以參考一下,希望對你有幫助!
由於某個原因,需要在PHP中呼叫R語音進行繪製影像。經過多方百度,目前大部分解決方案都是:利用PHP中的系統命令函數如exec,system,shell_exec等等來呼叫RScript腳本,常見的命令列有以下兩種
第一種:
exec("RScript " . $your_script_dir . "$your_RScript_file " . $args); // 里面有printf某个变量 // echo ("RScript " . $your_script_dir . "$your_RScript_file " . $args);
第二種:
system("R --slave < " . $your_RScript_dir . "$your_RScript_file" . " --args " . $args); // 里面有printf某个变量 // echo ("R --slave < " . $your_RScript_dir . "$your_RScript_file" . " --args " . $args);
接下來,我們滿懷信心地去運行PHP的時候,會發現我們所執行系統命令返回的值是1,也就是失敗。但是,我們拿echo出來的語句到cmd視窗執行,發現是可以printf出結果,也產生了我想要的圖像。這是為什麼呢?經過多方百度跟嘗試,終於找到解決方案。供大家參考並歡迎大家如果有更好的方法,也在留言區發文,大家共同努力進步。
一、簡單看下失敗的調用情況
這是我在PHP中調用的R腳本的語句,下面是在瀏覽器中呼叫的結果。
我們再將echo出來的語句,在cmd中執行下。結果如下:
產生的檔案如下:
可以看到,最後想要得到的$plotName是null,也就是沒有執行成功,或沒有得到cmd中列印出來的文件資訊。
二、解決方法
提供一個PHP插件,名字叫RServe,這個你如果是用Java來呼叫R語言的,想必並不陌生。現在出了PHP版的,我們就可以拿過來使用。下載地址:Rserve-php
三、如何使用
當然,插件有中間也有一些簡單的例子,可以自行參考理解。下面放出我的解決方法:本人是基於ThinkPHP5的框架實現的。
1. 我們首先要將它加入到我們的專案中,我把該插件放到我的vendor裡。新增以下程式碼:
require_once ROOT_PATH . 'vendor/rserve/autoload.php';
2. 依照自身需求使用裡面的一些類別
use Sentiweb\Rserve\Connection; // 连接R服务的类 use Sentiweb\Rserve\Evaluator; // 简单的理解为:建立连接后返回的处理器 use Sentiweb\Rserve\REXP\Vector; // 内置的存储容器
3. 寫RScript腳本
我們需要將先前所寫的腳本,修改為R語言的函數。格式如下:
RScript <- function(arg1, ..., argN) { # code... 请无视这种注释方式,R语言没有注释 return output # 该函数的返回值 }
為後期我們利用Rserve插件來呼叫。
4. 編寫我們的PHP函數
我們為了後期方便調用,將調用RScript腳本的功能統一寫到一個函數裡面,方便閱讀且容易維護。
class Common { // $source 表示自己编写的R语言函数文件 // $file, $cancer:本R函数所需要参数 function RScript($source, $file, $cancer) { $cnx = new Connection(RSERVE_HOST); // 与RSERVE_HOST建立连接,一般为自己服务器地址,如果本地,则为localhost $eval = new Evaluator($cnx, Evaluator::PARSER_REXP); // 通过连接,生成处理器,后一个参数决定连接失败时返回错误信息 $eval->evaluate("source('$source')"); // 类似library,将函数载入R的编程环境中;evaluate计算括号内的R命令 // 同理,执行R命令,注意括号内是字符串的形式,由于返回的是RServe的Rstring类,为了拿到我想要的信息,通过Vector类的toHTML转为含return信息的标签语言 $RString = $eval->evaluate("RScript('$file', '$cancer')")->toHTML(); preg_match("/$cancer.+.pdf/", $RString, $fileName); // 提炼信息 return $fileName[0]; // 返回结果 } }
5. 成功實現
這裡我就不展示我的最終結果了,有這需要的同學們可以自己嘗試。
四、失敗的原因
由於專案時間緊迫,對PHP、R語言熟悉度不高,不明白為什麼直接呼叫指令執行的結果是失敗的。有這方面認識的朋友們,可以在評論裡回覆我。以上就是我關於PHP如何呼叫R語言腳本的全部解決方案。謝謝大家的閱讀。
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