構成上的差異：
每個MyISAM在磁碟上儲存成三個檔案。第一個檔案的名字以表格的名字開始，副檔名指出檔案類型。
.frm檔案儲存表定義。
資料檔的副檔名為.MYD (MYData)。
索引檔案的副檔名是.MYI (MYIndex)。
基於磁碟的資源是InnoDB表空間資料檔案和它的日誌文件，InnoDB 表的大小只受限於作業系統文件的大小，一般為2GB
事務處理上方面:
MyISAM類型的表強調的是效能，其執行數度比InnoDB類型更快，但不提供事務支援
InnoDB提供交易支援事務，外部鍵等高階資料庫功能
SELECT UPDATE,INSERT，Delete操作
如果執行大量的SELECT，MyISAM是更好的選擇
1.如果你的數據執行大量的INSERT或UPDATE，出於性能方面的考慮，應該出於性能方面的考慮，應該出於性能方面的考慮，應該出於性能方面的考慮使用InnoDB表格
2.DELETE FROM table時，InnoDB不會重新建立表格，而是一行一行的刪除。
3.LOAD TABLE FROM MASTER操作對InnoDB是不起作用的，解決方法是先把InnoDB表改成MyISAM表，導入資料後再改成InnoDB表，但是對於使用的額外的InnoDB特性（例如外鍵）的表不適用
對AUTO_INCREMENT的操作
每表一個AUTO_INCREMEN列的內部處理。
MyISAM為INSERT和UPDATE作業自動更新這一列。這使得AUTO_INCREMENT列更快（至少10%）。在序列頂的值被刪除之後就不能再利用。 (當AUTO_INCREMENT列被定義為多列索引的最後一列，可以出現重複使用從序列頂部刪除的值的情況）。
AUTO_INCREMENT值可用ALTER TABLE或myisamch來重置
對於AUTO_INCREMENT類型的字段，InnoDB中必須包含只有該字段的索引，但是在MyISAM表中，可以和其他字段一起建立聯合索引
更好且更快的auto_increment處理
如果你為一個表指定AUTO_INCREMENT列，在資料詞典裡的InnoDB表句柄包含一個名為自動增長計數器的計數器，它被用在為該列賦新值。
自動增長計數器僅被儲存在主記憶體中，而不是存在磁碟上
關於該計算器的演算法實現，請參考
AUTO_INCREMENT列在InnoDB裡如何工作
表的具體行數
select count(*) from table,MyISAM只要簡單的讀出保存好的行數，注意的是，當count(*)語句包含 where條件時，兩個表的操作是一樣的
InnoDB 中不保存表的具體行數，也就是說，執行select count(*) from table時，InnoDB要掃描一遍整個表來計算有多少行
鎖定
表鎖定
提供行鎖定(locking on row level)，提供與Oracle 型別一致的不加鎖讀取(non-locking read in
SELECTs)，另外，InnoDB表的行鎖也不是絕對的，如果在執行一個SQL語句時MySQL不能確定要掃描的範圍，InnoDB表同樣會鎖定全表，例如update table set num=1 where name like “�a%”
