MBR和GPT各有各的特點，這兩個現在都在使用，至於選哪一個是要分情況討論的。
在設定新磁碟時，系統會詢問你是想要使用MBR還是GPT分割區。 GPT是一種新的標準，並在將來逐漸取代MBR。
GPT為我們帶來了許多新的特性，但MBR仍然擁有最好的相容性。 （推薦學習：PHP影片教學）
GPT並不是Windows專用的新標準，Mac OS X，Linux，及其他作業系統同樣使用GPT，實際上其他作業系統仍可使用MBR。新磁碟在使用之前，必須對其進行分割操作。
MBR（Master Boot Record）和GPT（GUID Partition Table）是在磁碟上儲存分割區資訊的兩種不同方式。 這些分割區資訊包含了每個分割區從哪裡開始的信息，這樣才能讓作業系統知道哪個磁區是屬於哪個分割區的，以及哪個分割區是可以啟動的。在磁碟上建立分割區時，必須在MBR和GPT之間選擇一個適當的分割區管理方式。
MBR的限制
MBR的意思是“主開機記錄”，最早在1983年在IBM PC DOS 2.0中提出。它是存在於磁碟機開始部分的一個特殊的啟動磁區，磁碟的第一個磁區。這個磁區包含了已安裝的作業系統的Bootloader和磁碟機的邏輯分割區資訊。 MBR最大支援2TB磁碟，它無法處理大於2TB容量的磁碟。 MBR支援最多4個主分割區－如果想要更多分割區，就需要建立所謂“擴展分割區”，並在其中建立邏輯分割區。 MBR已經成為磁碟分割和啟動的工業標準。
GPT的優勢
GPT意為GUID分區表。 （GUID意為全域唯一識別碼）。這是一個正逐漸取代MBR的新標準。
它和UEFI相輔相成－UEFI用來取代老舊的BIOS，而GPT則取代老舊的MBR。之所以叫作“GUID分區表”，是因為你的驅動器上的每個分區都有一個全局唯一的標識符（globally unique identifier，GUID）——這是一個隨機生成的字符串，可以保證為地球上的每一個GPT分區都分配完全唯一的識別碼。 GPT沒有MBR的那些限制。磁碟機容量幾乎不限制（還是有限制的，只不過對我們來說它太大太大）。
它也支援幾乎無限個分割區數量，限制只在於作業系統－Windows支援最多128個GPT分割區，而且你還不需要建立擴充分割區。在MBR磁碟上，分割區和啟動資訊是保存在一起的。如果這部分資料被覆蓋或破壞，事情就變得麻煩了。相對的，GPT在整個磁碟上保存多個
這部分資訊的副本，因此它更為健壯，並可以恢復被破壞的這部分資訊。
GPT也為這些資訊保存了循環冗餘校驗碼（CRC）以保證其完整和正確－如果資料被破壞，GPT會發覺這些破壞，並從磁碟上的其他地方進行恢復。而MBR則對這些問題無能為力──只有在問題出現後，你才會發現電腦無法啟動，或是磁碟分割區都不翼而飛了。
現代作業系統也同樣支援GPT。 Linux內建了GPT支援。蘋果公司基於Intel晶片的MAC電腦也不再使用自家的APT（Apple Partition Table），轉而使用GPT。
如果現在要進行分割的話，推薦使用GPT對磁碟進行分割。它更先進，更健壯，所有電腦系統都在轉移到其身上。 如果你需要保持對舊系統的相容性－例如在使用傳統BIOS的電腦上啟動Windows，你需要使用MBR。
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