首頁 > 後端開發 > Python教學 > 十個Pandas的另類資料處理技巧

十個Pandas的另類資料處理技巧

WBOY
發布: 2023-04-15 09:19:02
轉載
2416 人瀏覽過

本文所整理的技巧與以前整理過10個Pandas的常用技巧不同,你可能不會經常的使用它,但是有時當你遇到一些非常棘手的問題時,這些技巧可以幫你快速解決一些不常見的問題。

十個Pandas的另類資料處理技巧

1、Categorical類型

預設情況下,具有有限數量選項的欄位都會被指派object 類型。但是就記憶體來說並不是一個有效的選擇。我們可以這些列建立索引,並僅使用對物件的參考而實際值。 Pandas 提供了一種稱為 Categorical的Dtype來解決這個問題。

例如一個具有圖片路徑的大型資料集組成。每行有三列:anchor, positive, and negative.。

如果類別列使用 Categorical 可以顯著減少記憶體使用量。

# raw data
 +----------+------------------------+
 |class |filename|
 +----------+------------------------+
 | Bathroom | Bathroombath_1.jpg|
 | Bathroom | Bathroombath_100.jpg|
 | Bathroom | Bathroombath_1003.jpg |
 | Bathroom | Bathroombath_1004.jpg |
 | Bathroom | Bathroombath_1005.jpg |
 +----------+------------------------+
 
 # target
 +------------------------+------------------------+----------------------------+
 | anchor |positive|negative|
 +------------------------+------------------------+----------------------------+
 | Bathroombath_1.jpg| Bathroombath_100.jpg| Dinningdin_540.jpg|
 | Bathroombath_100.jpg| Bathroombath_1003.jpg | Dinningdin_1593.jpg |
 | Bathroombath_1003.jpg | Bathroombath_1004.jpg | Bedroombed_329.jpg|
 | Bathroombath_1004.jpg | Bathroombath_1005.jpg | Livingroomliving_1030.jpg |
 | Bathroombath_1005.jpg | Bathroombath_1007.jpg | Bedroombed_1240.jpg |
 +------------------------+------------------------+----------------------------+
登入後複製

filename欄的值會經常被複製重複。因此,所以透過使用Categorical可以極大的減少記憶體使用量。

讓我們讀取目標資料集,看看記憶體的差異:

triplets.info(memory_usage="deep")
 
 # Column Non-Null Count Dtype
 # --- ------ -------------- -----
 # 0 anchor 525000 non-null category
 # 1 positive 525000 non-null category
 # 2 negative 525000 non-null category
 # dtypes: category(3)
 # memory usage: 4.6 MB
 
 # without categories
 triplets_raw.info(memory_usage="deep")
 
 # Column Non-Null Count Dtype
 # --- ------ -------------- -----
 # 0 anchor 525000 non-null object
 # 1 positive 525000 non-null object
 # 2 negative 525000 non-null object
 # dtypes: object(3)
 # memory usage: 118.1 MB
登入後複製

差異非常大,並且隨著重複次數的增加,差異呈現非線性成長。

2、行列轉換

sql中常會遇到行列轉換的問題,Pandas有時候也需要,讓我們看看來自Kaggle比賽的資料集。 census_start .csv檔:

十個Pandas的另類資料處理技巧

可以看到,這些按年來保存的,如果有一個列year和pct_bb,並且每一行有相應的值,則會好得多,對吧。

cols = sorted([col for col in original_df.columns 
 if col.startswith("pct_bb")])
 df = original_df[(["cfips"] + cols)]
 df = df.melt(id_vars="cfips",
value_vars=cols,
var_name="year",
value_name="feature").sort_values(by=["cfips", "year"])
登入後複製

看看結果,這樣是不是就好很多了:

十個Pandas的另類資料處理技巧

#3、apply()很慢

我們上次已經介紹過,最好不要使用這個方法,因為它遍歷每行並呼叫指定的方法。但是要是我們沒有別的選擇,那還有沒有辦法提高速度呢?

可以使用swifter或pandarallew這樣的包,使過程並行化。

Swifter

import pandas as pd
 import swifter
 
 def target_function(row):
 return row * 10
 
 def traditional_way(data):
 data['out'] = data['in'].apply(target_function)
 
 def swifter_way(data):
 data['out'] = data['in'].swifter.apply(target_function)
登入後複製

Pandarallel

import pandas as pd
 from pandarallel import pandarallel
 
 def target_function(row):
 return row * 10
 
 def traditional_way(data):
 data['out'] = data['in'].apply(target_function)
 
 def pandarallel_way(data):
 pandarallel.initialize()
 data['out'] = data['in'].parallel_apply(target_function)
登入後複製

透過多線程,可以提高計算的速度,當然當然,如果有集群,那麼最好使用dask或pyspark

4、空值,int, Int64

標準整數資料型別不支援空值,所以會自動轉換為浮點數。所以如果資料要求在整數欄位中使用空值,請考慮使用Int64資料類型,因為它會使用pandas.NA來表示空值。

5、Csv, 壓縮還是parquet?

#盡可能選擇parquet。 parquet會保留資料類型,讀取資料時就不需要指定dtypes。 parquet檔案預設已經使用了snappy進行壓縮,所以佔用的磁碟空間小。下面可以看看幾個的對比

|file|size |
 +------------------------+---------+
 | triplets_525k.csv| 38.4 MB |
 | triplets_525k.csv.gzip |4.3 MB |
 | triplets_525k.csv.zip|4.5 MB |
 | triplets_525k.parquet|1.9 MB |
 +------------------------+---------+
登入後複製

讀取parquet需要額外的包,例如pyarrow或fastparquet。 chatgpt說pyarrow比fastparquet要快,但是我在小資料集上測試時fastparquet比pyarrow要快,但是這裡建議使用pyarrow,因為pandas 2.0也是預設的使用這個。

6、value_counts ()

計算相對頻率,包括獲得絕對值、​​計數和除以總數是很複雜的,但是使用value_counts,可以更容易地完成這項任務,並且此方法提供了包含或排除空值的選項。

df = pd.DataFrame({"a": [1, 2, None], "b": [4., 5.1, 14.02]})
 df["a"] = df["a"].astype("Int64")
 print(df.info())
 print(df["a"].value_counts(normalize=True, dropna=False),
df["a"].value_counts(normalize=True, dropna=True), sep="nn")
登入後複製

十個Pandas的另類資料處理技巧

這樣是不是就簡單很多了

7、Modin

注意:Modin現在還在測試階段。

pandas是單線程的,但Modin可以透過縮放pandas來加快工作流程,它在較大的資料集上工作得特別好,因為在這些資料集上,pandas會變得非常緩慢或記憶體佔用過大導致OOM。

!pip install modin[all]
 
 import modin.pandas as pd
 df = pd.read_csv("my_dataset.csv")
登入後複製

以下是modin官網的架構圖,有興趣的研究把:

十個Pandas的另類資料處理技巧

#8、extract()

如果經常遇到複雜的半結構化的數據,並且需要從中分離出單獨的列,那麼可以使用這個方法:

import pandas as pd
 
 regex = (r'(?P<title>[A-Za-z's]+),'
r'(?P<author>[A-Za-zs']+),'
r'(?P<isbn>[d-]+),'
r'(?P<year>d{4}),'
r'(?P<publisher>.+)')
 addr = pd.Series([
 "The Lost City of Amara,Olivia Garcia,978-1-234567-89-0,2023,HarperCollins",
 "The Alchemist's Daughter,Maxwell Greene,978-0-987654-32-1,2022,Penguin Random House",
 "The Last Voyage of the HMS Endeavour,Jessica Kim,978-5-432109-87-6,2021,Simon & Schuster",
 "The Ghosts of Summer House,Isabella Lee,978-3-456789-12-3,2000,Macmillan Publishers",
 "The Secret of the Blackthorn Manor,Emma Chen,978-9-876543-21-0,2023,Random House Children's Books"
])
 addr.str.extract(regex)
登入後複製

十個Pandas的另類資料處理技巧

9、读写剪贴板

这个技巧有人一次也用不到,但是有人可能就是需要,比如:在分析中包含PDF文件中的表格时。通常的方法是复制数据,粘贴到Excel中,导出到csv文件中,然后导入Pandas。但是,这里有一个更简单的解决方案:pd.read_clipboard()。我们所需要做的就是复制所需的数据并执行一个方法。

有读就可以写,所以还可以使用to_clipboard()方法导出到剪贴板。

但是要记住,这里的剪贴板是你运行python/jupyter主机的剪切板,并不可能跨主机粘贴,一定不要搞混了。

10、数组列分成多列

假设我们有这样一个数据集,这是一个相当典型的情况:

import pandas as pd
 df = pd.DataFrame({"a": [1, 2, 3],
"b": [4, 5, 6],
"category": [["foo", "bar"], ["foo"], ["qux"]]})
 
 # let's increase the number of rows in a dataframe
 df = pd.concat([df]*10000, ignore_index=True)
登入後複製

十個Pandas的另類資料處理技巧

我们想将category分成多列显示,例如下面的

十個Pandas的另類資料處理技巧

先看看最慢的apply:

def dummies_series_apply(df):
return df.join(df['category'].apply(pd.Series) 
.stack() 
.str.get_dummies() 
.groupby(level=0) 
.sum()) 
.drop("category", axis=1)
 %timeit dummies_series_apply(df.copy())
 #5.96 s ± 66.6 ms per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1 loop each)
登入後複製

sklearn的MultiLabelBinarizer

from sklearn.preprocessing import MultiLabelBinarizer
 def sklearn_mlb(df):
mlb = MultiLabelBinarizer()
return df.join(pd.DataFrame(mlb.fit_transform(df['category']), columns=mlb.classes_)) 
.drop("category", axis=1)
 %timeit sklearn_mlb(df.copy())
 #35.1 ms ± 1.31 ms per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 10 loops each)
登入後複製

是不是快了很多,我们还可以使用一般的向量化操作对其求和:

def dummies_vectorized(df):
return pd.get_dummies(df.explode("category"), prefix="cat") 
.groupby(["a", "b"]) 
.sum() 
.reset_index()
 %timeit dummies_vectorized(df.copy())
 #29.3 ms ± 1.22 ms per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 10 loops each)
登入後複製

十個Pandas的另類資料處理技巧

使用第一个方法(在StackOverflow上的回答中非常常见)会给出一个非常慢的结果。而其他两个优化的方法的时间是非常快速的。

总结

我希望每个人都能从这些技巧中学到一些新的东西。重要的是要记住尽可能使用向量化操作而不是apply()。此外,除了csv之外,还有其他有趣的存储数据集的方法。不要忘记使用分类数据类型,它可以节省大量内存。感谢阅读!

以上是十個Pandas的另類資料處理技巧的詳細內容。更多資訊請關注PHP中文網其他相關文章!

相關標籤:
來源:51cto.com
本網站聲明
本文內容由網友自願投稿,版權歸原作者所有。本站不承擔相應的法律責任。如發現涉嫌抄襲或侵權的內容,請聯絡admin@php.cn
熱門教學
更多>
最新下載
更多>
網站特效
網站源碼
網站素材
前端模板