1.正式環境有倉庫，但是當時同事為了方便，直接打了個包再測試環境進行開發了，現在開發完，新開發的這個部分沒有納入版本庫。不知道如何合併。
2.我現在基於dev分支，創建了一個new的分支，並將之前沒有納入版本庫的文件，直接替換掉new分支下的文件，並add commit。
3.我現在又基於dev分支，又創建了一個dev2的分支，切換到dev2下，merge new分支，發現merge過程中文件並沒有合併與產生衝突，而是刪除了dev2下的文件，新建了new分支下的那些檔案。
勞煩大家如果遇到類似的問題，請指點下。謝謝！
兩個問題。
你說的 “新開發的部分” 指的是哪個部分？
你現在需要把
dev2變成什麼樣子？可以試試git cherry-pick指令，可以把某個commit合入到某個分支。
git merge實際上會把你目前dev2分支最後的工作節點，new分支最後的節點和他們共同的父節點做一次三方合併，new分支相較於他們的共同節點相當於變更了全部文件，而dev2分支並沒有變化，所以git 會選擇自動merge 替換掉dev2 上的檔案
按照你的說法，你的同事應該是只調整了部分功能，可以考慮是用
git difftool來手動合併兩個分支