之前用
Eclipse的时候就会，后面换了PHPStorm后发现还是一样。以前无所谓，但现在试过三个系统后准备长期奋战linux了，所以希望能解决下。
只有在Linux下才会，Windows和Mac都不会...这个对于强迫症有点蛋疼（虽然ubuntu不时会也出几个小毛病）。
不知道大家是怎么解决的？谢谢大家
======= 补充下 ========
不是我不截图...是输入法到另外一个屏幕去了...不好截。
因为在很多发行版都有这个问题，我就没贴具体的版本
我的是
操作系统: ubuntu 16.04 64位
桌面: unity7(准备换8了)
输入法: fcitx
跟輸入法無關,應該跟Java Swing有關.
Netbeans/Jetbrains的產品這些基於Swing界面的程序在Linux上都有這個問題(輸入法出現在左下方).
採用了SWT本地化的Eclipse則沒有這個問題.
其實習慣了就好,沒什麼.
像系統自帶其他軟體以及Firefox/Chrome都沒有這些問題.
建議用Fcitx輸入法.
搜狗輸入法(建議)可以認為是基於國人Fcitx的一個模組.
試過三個系統後準備長期奮戰Linux
我感覺這不是個明智的決定
ArchLinux，兩個顯示器，搜狗輸入法，除了在IDE中輸入法會跑到左下角，其他的沒遇到過問題，也不會遇到輸入法跑到另一個屏幕去的情況。
PS：曾經有一段時間輸入法在IDE中的定位也不會有問題，去年年底重裝一次系統後就怎麼也弄不回去了，所以我覺得應該和系統的哪些配置有關係，或者Linux版本有關係。
補充
桌面平鋪管理器, 我用的
i3WM，有時間折騰的建議嘗試一下，我上手後就再也停不下來了..i3WM，有时间折腾的建议尝试一下，我上手后就再也停不下来了..主要功能大概就是所有的窗口都是平铺布局的，所以就不需要
Alt+Shift主要功能大概就是所有的窗口都是平鋪佈局的，所以就不需要Alt+Shift來切換窗口，主要透過快捷鍵來控制佈局的切換， 功能很強大，配置很簡單。不知道你用的是Gnome還是KDE？輸入法是 iBus 還是 fcitx 還是別的？
根據我的經驗，fcitx 的比 iBus 好一點，可以換來試試。
其它的建議不好給，Linux的桌面本來就很多坑。 。 。 。 。
ubutu 可以安裝搜狗輸入法，官網可以下載軟體包。
不知道你使用的是什麼視窗管理器/桌面環境？
部分桌面環境（如 Awesome）下，Java（特別是 Swing；SWT 好像還好）寫的 GUI 會出現滑鼠點擊位置不對、視窗空白等狀況。
wmname LG3D之後會好一點。