PHP于1994年由Rasmus Lerdorf创建，刚刚开始是Rasmus Lerdorf为了要维护个人网页而制作的一个简单的用Perl语言编写的程序。这些工具程序用来显示 Rasmus Lerdorf 的个人履历，以及统计网页流量。后来又用C语言重新编写，包括可以访问数据库。他将这些程序和一些表单直译器整合起来，称为 PHP/FI。PHP/FI 可以和数据库连接，产生简单的动态网页程序。
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在1995年以Personal Home Page Tools (PHP Tools) 开始对外发表第一个版本，Lerdorf写了一些介绍此程序的文档。并且发布了PHP1.0！在这的版本中，提供了访客留言本、访客计数器等简单的功能。以后越来越多的网站使用了PHP，并且强烈要求增加一些特性。比如循环语句和数组变量等等；在新的成员加入开发行列之后，Rasmus Lerdorf 在1995年6月8日将 PHP/FI 公开发布，希望可以透过社群来加速程序开发与寻找错误。这个发布的版本命名为 PHP 2，已经有 PHP 的一些雏型，像是类似 Perl的变量命名方式、表单处理功能、以及嵌入到 HTML 中执行的能力。程序语法上也类似 Perl，有较多的限制，不过更简单、更有弹性。PHP/FI加入了对MySQL的支持，从此建立了PHP在动态网页开发上的地位。到了1996年底，有15000个网站使用 PHP/FI。
在1997年，任职于 Technion IIT公司的两个以色列程序设计师：Zeev Suraski 和 Andi Gutmans，重写了 PHP 的剖析器，成为 PHP 3 的基础。而 PHP 也在这个时候改称为PHP：Hypertext Preprocessor。经过几个月测试，开发团队在1997年11月发布了 PHP/FI 2。随后就开始 PHP 3 的开放测试，最后在1998年6月正式发布 PHP 3。Zeev Suraski 和 Andi Gutmans 在 PHP 3 发布后开始改写PHP 的核心，这个在1999年发布的剖析器称为 Zend Engine，他们也在以色列的 Ramat Gan 成立了 Zend Technologies 来管理 PHP 的开发。
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