Java和C都是指令式语言（Imperative Language），不同的是Java有面向对象（OO）成分在里面，而C是完全面向过程的，C的高级版本C 、C#支持面向对象。
另外一个不同是，Java跨平台，既不同的操作系统都可以通过JVM来解释Java程序，而C、C 、C#则是与平台相关的，有些指令只在某些操作系统中才能执行。具体原因是，Java是解释型语言，所有代码都会翻译成统一的、与系统无关的bytecode，然后放到JVM上运行；而C是编译式语言，代码要先通过编译器转换成与系统相关的中间代码，然后才能运行。
再一个不同是，Java不支持系统调用，既无法与操作系统进行交互，这是由它跨平台的特点决定的，而C则可以调用系统中的指令，如fork()。这也就是为什么Java中只有线程（Thread）概念而没有进程（Process）概念，而C两者均有。
再者，Java无法对内存进行控制，而C则可以通过指针对内存进行人为分配。
还有一点，Java有Gabbage Collection机制，可以自动回收不再使用的空间，而C则要用free()函数释放空间。
总的来说，Java比较容易上手，学得快，但对于了解编程语言来说帮助不如C大。
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