区别：1、html()可以设置tbody、tr这些只读标签，而innerHTML在低版本IE下不行，不可以赋值，赋值的话就脚本报错；2、html()设置的script脚本会执行，innerHTML设置的script脚本不会执行。
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InnerHtml() 与html( )的区别
1、html()可以设置tbody、tr这些只读标签，而innerHTML在低版本IE下不行
在一个 HTML 文档中, 我们可以使用 .html() 方法来获取任意一个元素的内容。 如果选择器匹配多于一个的元素，那么只有第一个匹配元素的 HTML 内容会被获取。
innerHTML 是从对象的起始位置到终止位置的全部内容,包括Html标签
我原本一直以为innerHTML和jquery里的html其实是完全一样的，jquery是多此一举了，直到我遇到一次问题
看个示例：
var tbody=document.createElement('tbody'); tbody.innerHTML='<tr><td>IE下tbody的innerHTML是只读的</td></tr>'; //在IE下报错，目标对象错误
现在用jquery的html试试，
$(tbody).html('<tr><td>IE下tbody的innerHTML是只读的</td></tr>');
发现IE下用jquery能正确显示了，没任何问题。
后来查阅资料才知道：
jQuery的html()做了些容错处理，原生的Dom API innerHTML有些元素是不支持的，比如table tr等元素，IE下tbody、tr这些的innerHTML都是只读的，不允许写入，而在其他浏览器下则没问题。
jquery里是用了try，catch来检测，如果报错则在catch里重新调用this.empty().append(value)，是通过append来添加字符串的。
而IE里有些元素的innerHTML是只读的：
在IE6,IE7,IE8,IE9里面 col, colGroup, frameSet, html, head, style,table, tBody, tFoot, tHead, title, tr 这几个的innerHTML属性是只读的，不可以赋值，赋值的话就脚本报错。IE10这些标签的innerHTML改成可写的了。
既然在IE6-IE9里这些标签的innerHTML属性是只读的，那么我们尽量避免对这些标签的innerHTML属性赋值，比如说对table的innerHTML可以改为对table父元素(假设是p)的innerHTML属性赋值。
2、html()设置的script脚本会执行，innerHTML设置的script脚本不会执行。
因为jQuery 会把强行让参数字符串中的script 标签生效（方式是create and replace），而.innerHTML赋值则不会。
$('#app').html('<script>alert(1)</script>') // 会弹出警告框
$('#app')[0].innerHTML = '<script>alert(1)</script>' // 不会弹出警告框
// ↑使用[0]将jquery对象转为dom对象，只有dom对象才有innerHTML方法，jQuery没有。扩展资料：
html()函数的优点
看看innerHTML属性的缺点，就知道jQuery中html()函数的优点了，它是兼容所有浏览的，不存在html5标签不支持的问题，不存在href,src属性被转换的问题，不存在某些标签设置不了html串的问题，总之就是一句话，用它基本就万事无忧了，至少功能的实现上是这样。
html()函数的缺点
看来jQuery的html()函数似乎完美无限了，其实不然，它的完美只表现它的功能上，它兼容了所有浏览器，包括IE。但偏偏也是IE，尽管兼容了，性能并不乐观，如果使用html()函数设置大数据量的html串的话，那将是场灾难。
在IE下，html()函数的性能到底低到什么程度？电脑的配置为"i5 四核，8G内存，IE9"，测试了用html()函数设置2000行4列的table，其平均耗时达到27秒！具体什么原因导致html()在IE下这么慢，个人粗略看过源码，觉得使用try方式是主要原因之一，有兴趣的同学可以深入研究一下。
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