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Python中的EM算法是什么?

Jun 05, 2023 am 08:51 AM
python 统计学 em算法

Python中的EM算法是一种基于最大似然估计的迭代方法,常用于无监督学习中的参数估计问题。本文将从EM算法的定义、基本原理、应用场景和Python实现等方面进行介绍。

一、EM算法的定义

EM算法是Expectation-maximization Algorithm(期望最大化算法)的缩写。它是一种迭代算法,旨在求解给定观测数据的最大似然估计。

在EM算法中,需要假设样本数据来自于某个概率分布,且该分布的参数未知,需要通过EM算法来估计。EM算法假设该未知参数可以分为两类,一类是可观测变量,另一类是不可观测变量。通过迭代,将不可观测变量的期望值作为参数的估计值,再重新求解,直到收敛为止。

二、EM算法的基本原理

  1. E步骤(Expectation)

在E步骤中,需要根据当前的参数估计值,计算出隐变量的概率分布,即求解出每个隐变量的条件分布,也就是隐变量的期望值。这个期望值是基于当前的参数估计值计算得到的。

  1. M步骤(Maximization)

在M步骤中,需要根据E步骤计算得到的隐变量的期望值,重新估计当前的参数值。这个估计值是基于E步骤计算得到的隐变量的期望值计算得到的。

  1. 更新参数值

通过E步骤和M步骤的迭代,最终会得到一组参数估计值。如果该估计值收敛,则算法结束,否则继续迭代。每一步迭代都会优化参数值,直到找到最优的参数估计值。

三、EM算法的应用场景

EM算法广泛应用于无监督学习领域,如聚类分析、模型选择和隐马尔可夫模型等,具有较强的鲁棒性和迭代效率高的优点。

例如,在聚类问题中,EM算法可以用于高斯混合模型的参数估计,即将观测数据分布建模为多个高斯分布的混合模型,将样本进行分组,使得每一组内的数据服从相同的概率分布。在EM算法中,该问题是通过E步骤对数据进行分组,M步骤对高斯分布的参数进行更新,来进行求解的。

另外,在图像处理中,EM算法也经常被用于图像分割和图像去噪等任务中。

四、Python实现EM算法

在Python中,可以使用EM算法进行参数估计的函数有很多,例如SciPy库中的EM算法实现、scikit-learn库中的高斯混合模型GMM、TensorFlow库中的变分自编码器VAE等。

下面以SciPy库的EM算法实现为例进行介绍。首先需要在Pyhton中进行如下导入:

import scipy.stats as st
import numpy as np
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然后,定义一个高斯混合模型的概率密度函数作为EM算法的优化目标函数:

def gmm_pdf(data, weights, means, covs):
    n_samples, n_features = data.shape
    pdf = np.zeros((n_samples,))
    for i in range(len(weights)):
        pdf += weights[i]*st.multivariate_normal.pdf(data, mean=means[i], cov=covs[i])
    return pdf
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接下来,定义EM算法的函数:

def EM(data, n_components, max_iter):
    n_samples, n_features = data.shape
    weights = np.ones((n_components,))/n_components
    means = data[np.random.choice(n_samples, n_components, replace=False)]
    covs = [np.eye(n_features) for _ in range(n_components)]

    for i in range(max_iter):
        # E步骤
        probabilities = np.zeros((n_samples, n_components))
        for j in range(n_components):
            probabilities[:,j] = weights[j]*st.multivariate_normal.pdf(data, mean=means[j], cov=covs[j])
        probabilities = (probabilities.T/probabilities.sum(axis=1)).T

        # M步骤
        weights = probabilities.mean(axis=0)
        means = np.dot(probabilities.T, data)/probabilities.sum(axis=0)[:,np.newaxis]
        for j in range(n_components):
            diff = data - means[j]
            covs[j] = np.dot(probabilities[:,j]*diff.T, diff)/probabilities[:,j].sum()

    return weights, means, covs
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最后,可以使用如下代码来测试EM算法:

# 生成数据
np.random.seed(1234)
n_samples = 100
x1 = np.random.multivariate_normal([0,0], [[1,0],[0,1]], int(n_samples/2))
x2 = np.random.multivariate_normal([3,5], [[1,0],[0,2]], int(n_samples/2))
data = np.vstack((x1,x2))

# 运行EM算法
weights, means, covs = EM(data, 2, 100)

# 输出结果
print('weights:', weights)
print('means:', means)
print('covs:', covs)
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参考文献:

[1] Xu, R. & Wunsch, D. C. (2005). Survey of clustering algorithms. IEEE Transactions on Neural Networks, 16(3), 645-678.

[2] Blei, D. M., Ng, A. Y., & Jordan, M. I. (2003). Latent dirichlet allocation. Journal of Machine Learning Research, 3(4-5), 993-1022.

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